Missions

Notre laboratoire vise à comprendre comment l’identité cellulaire et la mémoire épigénétique sont maintenues ou altérées au cours de la division cellulaire dans le modèle de la différenciation lymphoïde B. Pour cela, nous utilisons des technologies innovantes combinant le tri de chromosomes mitotiques par cryométrie en flux avec des approches multi-omiques - protéomique, RNA-seq, accessibilité de la chromatine - afin d’analyser des chromosomes mitotiques natifs (non fixés). Notre objectif est d’identifier les facteurs protéique et épigénétique qui rester associés à la chromatine pendant la mitose, agissant comme de ‘bookmarkers mitotique’ et permettant ainsi la réactivation des programmes transcriptionnels dans les cellules filles.
Ce projet postdoctoral, financé par le programme de recherche ATIP-Avenir (CNRS), porte sur l’inactivation du chromosome X (ICX), un paradigme de la mémoire épigénétique au cours de la division cellulaire, et son lien avec les maladies auto-immunitaires largement plus prévalent chez les femmes. Le chromosome X est enrichi en gènes liés à l’immunité, et la maintenance stable de l’ICX est reconnu comme un élément clé de la régulation immunitaire. Ce projet vise à (1) Définir le protéome mitotique des chromosomes X actif et inactif dans les cellules lymphoïdes B humaines. (2) Identifier les facteurs candidats impliqués dans la mémoire mitotique du chromosome X, et (3) Étudier leur rôle dans la régulation du dosage des gènes immunitaires portés par le chromosome X, avec des implications potentielles pour la compréhension de la régulation des réponses immunitaire lié à l’X.

Activités

• Tri de chromosomes mitotiques par cryométrie en flux
• Réalisation d’approches multiomiques : protéomique, épigénomique, ATAC-seq, RNA-seq
• Analyse de données omiques en collaboration avec les plateformes de bioinformatique
• Validation et étude fonctionnelle des facteurs candidats par des approches CRISPR/Dégrons et analyse transcriptionnelle
• Présentation des résultats en réunions d’équipe, séminaires et conférences
• Rédaction de manuscrits et contribution à la valorisation scientifique du projet

Compétences

• Solide formation en biologie moléculaire et cellulaire
• Intérêt marqué pour l’épigénétique, la différenciation cellulaire et l’immunologie
• Expérience avec au moins une approche omique (ATAC-seq, RNA-seq, ChIP, etc.)
• Compétences en culture cellulaire et manipulation de lignées cellulaires souches et cellules primaires
• Rigueur scientifique, esprit critique, autonomie et bonne capacité à travailler en équipe
• Maîtrise de l’anglais (oral et écrit)
• Une première publication en premier auteur est fortement souhaitée

Contexte de travail

Le ou La candidat/e retenu/e rejoindra un laboratoire dynamique ayant des collaborations solides et intégré dans un réseau de six équipes au sein du Centre d’Épigénétique et du Destin Cellulaire (EDC) UMR 7216. L’institut est situé au cœur de Paris, sur le campus Paris Rive-Gauche de l’Université Paris Cité, et bénéficie d’un accès à des plateformes technologiques de pointe en protéomique, cryométrie en flux, imagerie, ingénierie du génome et bioinformatique, à l’EDC et l’Institut Jacques Monod.

Contraintes et risques

• Manipulation de cellules humaines et de matériel biologique
• Exposition possible à des produits chimiques de laboratoire standards
• Horaires ponctuellement décalés selon disponibilité
• Respect strict des règles d’hygiènes et sécurité de laboratoire et des protocoles en environnement confiné (L2)