Missions

Cette position d’ingénieur est disponible dans l’équipe Photosymbiose (photosymbiosis.com) au laboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale. L’ingénieur fera partie du projet SymbiOcean financé par une bourse ERC consolidator, qui vise à étudier les photosymbioses du plancton marin à l’échelle subcellulaire, moléculaire et écologique. L´objectif principal du projet est de comprendre les changements morphologiques d’une microalgue marine en symbiose en appliquant la microscopie électronique 3D en mode cryogénique (cryo-TEM), avec un focus sur les chloroplastes. Ce type de microscopie permet la visualisation en 3D d'organelle et macrocomplexes protéique dans leur état natif (dans la glace) à haute résolution. L’ingénieur aura comme mission de collecter les symbioses planctoniques en mer et de mettre en place un protocole pour l’observation en microscopie électronique en mode cryogénique (cryo-ET).

Activités

- Échantillonnage de symbioses planctoniques sur le terrain
- Développement d'une préparation d’échantillon pour microscopie électronique (cryo-ET)
- Microscopie fluorescence en mode cryogénique
- Activité possible : Analyse d’images (segmentation, reconstruction 3D) à partir de microscopie électronique 3D
- Assurer une veille scientifique pour implémenter de nouvelles méthodes

Compétences

- Biologie cellulaire ou biophysique en utilisant la microscopie électronique et/ou corrélative (microscopie à fluorescence).
- Connaissances et expertise en préparation d’échantillons pour la microscopie électronique 3D (FIB-SEM, cryo-TEM) et microscopie fluorescence en mode cryo.
- OU Connaissances et expertise en analyse d’images pour reconstruction 3D après cryo-TEM.
- Aptitude à travailler de manière autonome dans un environnement interdisciplinaire et international, et d´interagir dans un groupe de recherche jeune et dynamique et avec les collaborateurs.

Contexte de travail

L’ingénieur fera partie de l´équipe Photosymbiose (photosymbiosis.com) du laboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale (UMR 5168 – CNRS –CEA – Univ. Grenoble Alpes - INRAe) au sein de l’institut IRIG du CEA de Grenoble. Les projets de l´équipe visent à mieux comprendre le fonctionnement des photosymbioses unicellulaires en combinant des approches de microscopie subcellulaire (nanoSIMS, Synchrotron X-Ray fluorescence, microscopie électronique 3D). Localement, le projet sera en étroite collaboration avec l’institut IRIG : plateforme INAC (IRIG) et l’Institut de Biologie Structurale (IBS, Grenoble). Cette position s’insère dans un projet financé par une ERC consolidator (SymbiOCEAN) mené par l’équipe Photosymbiose. De nombreuses interactions se feront avec les plateformes d’imagerie de Grenoble et EMBL, et les partenaires locaux et internationaux du projet lors de meetings et échantillonnages sur le terrain.

Contraintes et risques

Pas de contraintes ou risques