Description du sujet de thèse

Ce projet de thèse, financé par le programme 80 Prime du CNRS, s’inscrit dans une collaboration entre deux équipes de recherche aux expertises complémentaires en biologie cellulaire et en biophysique membranaire. Il a pour objectif d’élucider les mécanismes structuraux, moléculaires et biophysiques qui régulent la formation, la croissance et le renouvellement des gouttelettes lipidiques (LDs) au niveau des Membranes du réticulum endoplasmique (RE) Associées aux Mitochondries, appelées MAMs.
Les LDs sont des organites dynamiques essentiels au stockage des lipides et à l’homéostasie énergétique. Leur dysfonctionnement est impliqué dans diverses pathologies métaboliques telles que l’obésité, le diabète, les lipodystrophies et les maladies neurodégénératives. Les MAMs, zones de contact spécialisées entre le RE et les mitochondries, constituent des plateformes majeures pour l’échange lipidique entre ces organites.
L’équipe a récemment mis en évidence une jonction tripartite inédite entre mitochondries, réticulum endoplasmique et gouttelettes lipidiques (MAM-LD), présentant des caractéristiques morphologiques et fonctionnelles uniques. Elle cherche à en caractériser l’architecture et les composantes moléculaires. Une attention particulière sera portée aux transporteurs lipidiques localisés aux MAMs, susceptibles de réguler localement le flux de phospholipides et de stérols, et d’influencer le devenir des lipides (stockage versus conversion métabolique).
Le·la doctorant·e adoptera une approche interdisciplinaire combinant diverses techniques d’imagerie cellulaire (microscopie confocale et à haute résolution, microscopie électronique en transmission et 3D FIB-SEM), de fractionnement subcellulaire, de biochimie, de biophysique membranaire, ainsi que des essais de transfert lipidique in vitro et ex vivo.
Les objectifs du projet sont les suivants :
1. Caractériser la morphologie et la composition moléculaire des jonctions MAM-LD dans différents types cellulaires et états métaboliques, notamment dans des contextes pathologiques (stéatose hépatique, lipodystrophies).
2. Étudier le rôle fonctionnel des protéines du métabolisme et du transport lipidique dans la régulation de la dynamique des LDs et des mitochondries.
3. Explorer la coordination des échanges lipidiques aux MAMs avec d’autres sites de contact intracellulaires, comme les jonctions RE–membrane plasmique.
Les résultats attendus permettront de mieux comprendre comment les MAMs agissent comme centres de coordination des flux lipidiques intracellulaires, et leur rôle potentiel dans des maladies telles que l’obésité, le diabète, les pathologies neurodégénératives ou certains cancers.

Contexte de travail

Le projet se déroulera à l’I2BC (Institut de Biologie Intégrative de la Cellule), une unité mixte de recherche du CNRS, du CEA et de l’Université Paris-Saclay, rassemblant environ 600 chercheurs répartis en cinq départements scientifiques. L’institut bénéficie de 17 plateformes technologiques de pointe et de services de soutien mutualisés.
Le.la doctorant.e sera intégré à l’équipe « Trafic de Lipides et Sites de Contact Membranaires », dirigée par Francesca Giordano, au sein du département de Biologie Cellulaire, sur le campus CNRS de Gif-sur-Yvette (Île-de-France). L’équipe, actuellement composée de six membres (1 DR Inserm, 1 postdoctorant, 2 assistants ingénieurs et 2 doctorants), accueillera trois nouveaux membres en septembre 2025 (1 postdoctorant, 1 maître de conférences invité et 1 doctorant invité). Elle possède une expertise reconnue en dynamique membranaire, imagerie électronique et étude des sites de contact entre organites.
Le.la doctorant.e bénéficiera d’un encadrement direct par la responsable d’équipe et un postdoctorant expert en imagerie haute résolution et analyse lipidique, ainsi que du soutien technique d’un ingénieur spécialisé en microscopie électronique. Il évoluera dans un environnement scientifique stimulant, avec un accès privilégié à des plateformes technologiques de haut niveau. Un atout majeur du projet est la proximité immédiate de la plateforme Imagerie-Gif, dotée d’équipements de dernière génération en microscopie à fluorescence et électronique, ainsi que de la plateforme de protéomique.
Le projet sera mené en étroite collaboration avec l’équipe du Dr Abdou Rachid Thiam (ENS Paris, Laboratoire de Physique), spécialiste de la biophysique des gouttelettes lipidiques et de la reconstitution de membranes ex vivo. Dans le cadre du programme de doctorat 80 Prime, le·la doctorant·e aura l’opportunité de participer régulièrement à des travaux collaboratifs et de bénéficier de formations au sein de cette équipe. Le projet profitera également des collaborations en cours de l’équipe de F. Giordano — sur le campus Paris-Saclay ainsi qu’à l’échelle nationale et internationale — avec des experts du métabolisme lipidique et de la physiologie des adipocytes.

Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.

Contraintes et risques

Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.