Ingénieur-e biologiste en plateforme scientifique H/F

Job Description

Missions

L'ingénieur(e) sera impliqué(e) dans les projets de l'Institut consacrés à l'étude des circuits visuels, de la souris à l'humain, en s'appuyant sur une combinaison de méthodes optiques avancées pour la manipulation holographique des circuits visuels par optogénétique, en association avec des techniques d'électrophysiologie de type patch-clamp.
Son travail expérimental reposera sur les microscopes de la plateforme d'optogénétique biphotonique (2P) ainsi que sur les systèmes optiques développés par l'équipe Emiliani. Il/elle sera en charge de l'intégration de ces systèmes avec les approches d'enregistrement électrophysiologique.

Il/elle aura également accès aux plateformes de l'Institut dédiées à la préparation d'explants rétiniens de diverses espèces, et contribuera à l'amélioration continue des techniques qui y sont développées.
Il/elle mettra également à disposition des équipes de l'Institut le savoir-faire acquis progressivement sur la préparation d'explants rétiniens exprimant des sondes optogénétiques ou des indicateurs fluorescents d'activité. Il/elle assurera la coordination scientifique de la partie biologique des projets de recherche menés au sein des équipes Emiliani et Tessier, dans le cadre de l'étude des circuits rétiniens pour la restauration visuelle. Il/elle apportera également un soutien technique et scientifique aux autres projets de l'Institut portant sur la rétine et nécessitant l'utilisation de la plateforme d'optogénétique.
Enfin, il/elle participera à la rédaction de projets de recherche et contribuera à la réponse à des appels d'offres, tant nationaux qu'internationaux, en vue de contribuer à l'obtention de financements.

Activity

- Concevoir et conduire des projets en neurophysiologie des circuits visuels, dans le cadre des développements optiques appliqués à l'optogénétique et à la restauration visuelle, en combinant des techniques d'électrophysiologie en patch-clamp avec l'optogénétique et l'imagerie multi-photonique.
- Définir un ensemble cohérent de techniques d'imagerie multiphotonique et d'outils optogénétiques nécessaires aux expérimentations sur la rétine et le système nerveux central, en collaborant et conseillant les utilisateurs.
- Préparer les expériences d'optogénétique et d'électrophysiologie ex vivo sur le cerveau et la rétine de souris, ainsi que sur des explants rétiniens de primates non humains.
- Concevoir et optimiser les vecteurs viraux AAV dédiés à l'optogénétique.
- Développer et mettre à point les expériences d'optogénétique pour la restauration visuelle, et contribuer à l'amélioration continue des techniques et les préparations qui y sont développées.
- Traiter les données : analyse et interprétation des résultats d'imagerie, électrophysiologie et d'optogénétique.
- Assurer une veille scientifique et technologique dans le domaine de la neurophotonique et de l'optogénétique.
- Faire appliquer les normes d'hygiène et de sécurité en expérimentation animale aux utilisateurs des système des équipes ou de la plateforme.
- Participer à la rédaction de projets de recherche et de publications scientifiques.
- Présenter les résultats lors de conférences scientifiques nationales et internationales.
- Encadrer des personnels spécialisés en biologie et neurobiologie de tout niveau.
- Préparer les démarches réglementaires liées aux projets.

Your Profil

Skills

- Connaissances en anatomie, neurophysiologie et fonctions du cortex visuel et de la rétine.
- Compétences solides en physiologie cellulaire, biophysique des canaux ioniques et mécanismes de signalisation neuronale.
- Expertise en illumination neuronale par holographie et biophysique des opsines. Maîtrise de l'optogénétique biphotonique appliquée à l'étude des neurones corticaux et des cellules rétiniennes (imagerie calcique/voltage, modulation de l'activité).
- Maîtrise des techniques d'électrophysiologie du patch-clamp.
- Compétences solides d'analyse des données d'électrophysiologie et d'imagerie biphotonique.
- Maîtrise des techniques de neurobiologie : chirurgie, imagerie in vivo/in vitro, électrophysiologie, injections virales, dissection, cultures cellulaires, transfections, transduction AAV (modèle murins et rétine de primate).
- Connaissance des réglementations en matière d'expérimentation animale, sécurité en laboratoire (L2, lasers), hygiène et biosécurité.
- Rédaction des protocoles d'expérimentation animale ( APAFIS) et des declaration OGM.
- Participation à la conception et à la rédaction de projets de recherche interdisciplinaires en optogénétique.
- Encadrement d'étudiants (M2, doctorants, ingénieurs).
- Aptitude au travail en équipe en environnement interdisciplinaire.
- Conférences et publications scientifiques en optogénétique.
- Communication scientifique écrite et orale (présentations, rédaction de rapports et manuscrits).
- Forte capacité d'autonomie, rigueur, organisation et planification expérimentale.

Your Work Environment

Situé sur le campus de l'Hôpital national des 15-20 Centre Hospitalier National d'Ophtalmologie des 15-20 (CHNO des XV-XX), l'Institut de la Vision est un centre de recherche interdisciplinaire Sorbonne Université, INSERM et CNRS, dirigé par le Dr Serge Picaud. Il est organisé en 5 départements et 18 équipes de recherche. L'institut dispose d'installations de culture cellulaire (cellules souches et organotypiques), de biologie moléculaire pour la conception et production de virus, ainsi que d'une animalerie rongeurs équipée pour la chirurgie et l'injection stéréotaxique d'AAV. Le département de Photonique comprend un atelier électromécanique avec imprimante 3D.

Au sein de ce département, l'équipe Emiliani développe des méthodes optiques avancées pour l'étude des circuits visuels, de la rétine au LGN jusqu'au cortex visuel. Elle compte environ 35 membres, dont 8 chercheurs permanents, avec des expertises en photonique, microscopie non linéaire, optogénétique et neurophysiologie. Elle dispose de systèmes optiques uniques sur mesure, développés pour l'activation par holographie multiphotonique, l'imagerie fonctionnelle (voltage et calcique), l'électrophysiologie et la stimulation visuelle.

L'équipe Tessier développe de méthodes optiques d'imagerie sans marquage fluorescent, incluant l'imagerie de phase et volumique. Elle compte aujourd'hui 7 membres, dont 3 enseignants-chercheurs permanents et un directeur de recherche CNRS émérite, avec des compétences en photonique, microscopie non linéaire, holographie numérique, imagerie de phase et photométrie.

La plateforme regroupe un système de microscopie intégrant imagerie bi-photonique (2P), photostimulation holographique 2P, stimulation optique de photorécepteurs et électrophysiologie.

Compensation and benefits

Compensation

Annual leave and RTT

44 jours

Remote Working practice and compensation

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

About the offer

About the CNRS

The CNRS is a major player in fundamental research on a global scale. The CNRS is the only French organization active in all scientific fields. Its unique position as a multi-specialist allows it to bring together different disciplines to address the most important challenges of the contemporary world, in connection with the actors of change.

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