Description du sujet de thèse

Mécanismes moléculaires de l'emballage du génome de l'influenza

Les virus de la grippe possèdent un génome segmenté en ARN, composé de huit segments distincts. Pour former des virions infectieux, ces huit segments doivent être emballés avec succès dans une seule particule virale lors de l'assemblage viral. Ce processus d'emballage est hautement spécifique et finement régulé, mais les mécanismes moléculaires qui régissent l'incorporation sélective de ces segments d'ARN restent mal compris. Une compréhension approfondie du mécanisme d'emballage du génome de la grippe est cruciale pour décrypter l'évolution du virus, en particulier lors des événements de réassortiment – où des segments provenant de différentes souches peuvent se recombiner, entraînant l'émergence de nouvelles souches virales ayant un potentiel pandémique.

Ce projet de thèse vise à explorer les bases moléculaires de l'emballage du génome de l'influenza en étudiant comment la structure de l'ARN et les motifs de séquence agissent comme des signaux d'emballage. Le candidat utilisera une combinaison de techniques de biologie de l'ARN et de virologie, notamment des techniques de sondage structural de l'ARN et des tests basés sur le séquençage, afin de cartographier les motifs de structure secondaire fonctionnels au sein des segments d'ARN viral. En combinant ces techniques avec des tests virologiques, le projet identifiera les motifs structurels clés de l'ARN qui médiatisent les interactions spécifiques lors de l'assemblage du génome.

Contexte de travail

Le laboratoire du Dr Redmond Smyth, situé au sein de l'Institut de biologie moléculaire et cellulaire (IBMC), étudie les mécanismes de réplication et d'assemblage des virus en utilisant des techniques avancées de biologie de l'ARN. L'équipe du Dr Smyth se concentre sur la caractérisation des structures et des fonctions des ARN viraux, avec des applications potentielles pour le développement de nouvelles approches thérapeutiques antivirales. L'IBMC est une unité de recherche renommée sous la tutelle du Centre national de la recherche scientifique (CNRS), situé à Strasbourg. L'IBMC se distingue par son environnement scientifique de pointe, dédié à la compréhension des mécanismes fondamentaux de la biologie moléculaire et cellulaire. Ses recherches couvrent différents domaines, allant de la biologie structurale et des interactions moléculaires à la génétique, l'immunologie et la virologie, contribuant ainsi à des avancées cruciales en biologie et en médecine.

Le laboratoire bénéficie d'un large réseau de collaborations nationales et internationales et d'un accès à des plateformes technologiques de pointe, notamment la microscopie avancée, le séquençage à haut débit et la spectrométrie de masse. Avec des équipes de recherche multidisciplinaires et un cadre dynamique, l'IBMC offre un environnement stimulant et propice à l'innovation scientifique. L'IBMC est également affilié à l'Université de Strasbourg, ce qui lui donne un accès direct à une communauté académique active et à d'excellents programmes doctoraux. Le candidat sera inscrit à l'école doctorale de l'université.

Contraintes et risques

Le ou la candidat(e) devra travailler avec des virus grippaux vivants. Un équipement de protection individuelle approprié et une formation à la sécurité biologique seront fournis.