Description du sujet de thèse

Développement et mise en oeuvre d'outils moléculaires permettant de détecter, caractériser et quantifier les différents agents pathogènes responsables d’infections sexuellement transmissibles (IST) dans les eaux usées.
- Mise en place d'un suivi longitudinal permettant la surveillance de la diversité et de la quantité de ces agents dans la population étudiante et générale
- Comparaison de ces données avec les données de dépistages effectués sur les patients, ainsi qu’avec les cas de cancers liés aux infections sexuellement transmissibles (IST).
- Construction d'indicateurs de santé des habitants et des étudiants

Contexte de travail

Le laboratoire de virologie moléculaire de l’UPR-9002 du CNRS est localisé à l’IUT Louis Pasteur de Schiltigheim. Le doctorant (H/F) intègrera le groupe « WBE- Wastewater-based epidemiology » sous la responsabilité du Dr Clémentine WALLET. Le groupe WBE compte actuellement 5 collaborateurs, dont une étudiante en thèse, une ingénieure d’étude et une technicienne. Le groupe accueille également des stagiaires de master et de BUT.

Dans le cadre du projet PEPR-WHAOU, Ville durable France 2030 (financé pour 3 ans) et avec le support de la plateforme OBEPINE +, nous développerons la détection et le suivi épidémiologique des virus et bactéries pathogènes responsables d’infections sexuellement transmissibles (IST). L’objectif sera d’établir des outils et des indicateurs de la qualité de vie et de la santé des habitants en analysant les eaux usées. Nous développerons les outils d’identifications adaptés à chaque virus et bactéries.


Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.

Contraintes et risques

Travail avec des eaux usées issues de stations d'épuration et de collecteurs.