Description du sujet de thèse

Le sujet d’étude porte sur l’identification du mécanisme de compétition pour la biosynthèse du peptidoglycan bactérien au cours du cycle cellulaire, en particulier grâce à l’étude de protéines Mur chimériques naturellement présentes dans certains génomes bactériens.
L’étudiant utilisera des techniques de biologie moléculaire, biochimie, cristallographie des rayons X et microscopie confocale et de fluorescence.
Activités :
- Produire les protéines chimériques recombinantes impliquées dans la biosynthèse du précurseur du peptidoglycan bactérien.
- Résoudre la structure tri-dimensionnelle de ces protéines chimériques.
- étudier l’implication de mutations dans le recrutement du peptidoglycan au cours des différentes étapes du cycle cellulaire par microscopie confocale et de fluorescence.
- Disséminer les résultats en réunions de groupe et en colloque spécialisé sur la paroi bactérienne

Compétences :
- Connaissance en biologie moléculaire, biochimie et purification de protéines recombinantes.
- Intérêt pour la biologie structurale demandé.
- Anglais (écrit/oral) niveau C1.
- Capacité à travailler de façon indépendante dans un environnement multidisciplinaire.

Contexte de travail

Situé sur le Polygone scientifique de Grenoble (ESRF/ILL/EMBL/IBS), l’Institut de Biologie Structurale (IBS) est un acteur d’envergure nationale et internationale dans le domaine de la biologie structurale intégrée. A la fois centre de recherche, plateau technique, site d'accueil et de formation scientifique, l'IBS a pour vocation le développement de recherches en biologie structurale, un champ de recherche capital pour la compréhension des mécanismes biologiques fondamentaux. Il s’appuie sur 12 plateformes à la pointe de la technologie.
En tant qu’unité mixte de recherche (CEA-CNRS-UGA) l’IBS est composé de 20 groupes de recherche, chacun de ces groupes proposant une approche multi-disciplinaire, aux frontières de la biologie, de la physique et de la chimie, en cohérence avec 3 axes de recherche. Près de 320 personnes y travaillent chercheurs, doctorants, ingénieurs et techniciens dans un environnement multiculturel et international.
La personne recrutée intègrera le groupe Pneumocoque de l’IBS. (https://www.ibs.fr/fr/recherche/microbiologie-infection-et-immunite/groupe-pneumocoque-c-morlot/)

Contraintes et risques

- La recherche se fera indifféremment en français ou anglais, néanmoins il est attendu que le candidat non-francophone s'efforce d'apprendre les bases du français afin de faciliter la communication et son intégration dans le laboratoire.
- Le télétravail sera autorisé à uniquement en période de rédaction de thèse.