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Ingénieur/e en microscopie photonique appliquée à la biologie (H/F)


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Informations générales

Référence : UMS3426-EDIDEM0-014
Lieu de travail : MONTPELLIER
Date de publication : lundi 3 février 2020
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 avril 2020
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Entre 2097 et 2206 € brut mensuel selon expérience
Niveau d'études souhaité : Bac+3
Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

L'ingénieur-e d'études participera à l'étude, au développement, à la mise au point de l'imagerie histologique grâce à des scanners de lames de la plateforme MRI situés sur le plateau MRI-INM et à certains microscopes du plateau MRI-CRBM. L'ingénieur-e participera à l'évaluation et l'amélioration d'un prototype de scanner de lames fluorescentes en partenariat avec une entreprise régionale et la plateforme de peignage moléculaire de Montpellier (MDC).

Activités

- Evaluer les performances et contribuer à l'amélioration du prototype de scanner de lames mis à disposition par notre partenaire industriel : d'un point de vue matériel (métrologie) mais aussi si les données produites sont facilement manipulables et utilisables dans un logiciel d'analyse d'images histologiques.
- Accompagner l'ingénieur de la plateforme de peignage moléculaire sur le prototype pour réaliser les scans de lamelles préparées par la plateforme MDC. Evaluer la qualité des scans.
- Développer une analyse d'images de pré-reconnaissance des régions à scanner et l'intégrer à l'interface du logiciel d'acquisition avec l'aide du partenaire industriel.
- Rendre compte se des activités et participer aux réunions de suivi de projet.
- Conseiller, accompagner et former les utilisateurs aux scanners de lames Nanozoomer et Axioscan du plateau MRI-INM. Comparer la performance du prototype avec ces scanners.
- Procéder à l'optimisation et aux réglages des dispositifs expérimentaux pour garantir un service qualité / cahier des charges
- Assurer la maintenance, aide au diagnostic des problèmes de fonctionnement, implémentation de nouvelles modalités d'imagerie, en contact avec les techniciens SAV
- Réaliser une fois par semaine les scans des lames produites par la plateforme d'histologie de Montpellier
- Conseiller, accompagner et former les utilisateurs qui souhaitent réaliser de l'imagerie sur des échantillons de tissus.
- Assurer une veille scientifique et technologique relative à la microscopie photonique
- Respecter les procédures qualité en rigueur (ISO9001)

Compétences

Connaissances et compétences
- Savoir-faire sur l'utilisation des microscopes photoniques
- Maîtrise de l'outil informatique et des logiciels de traitement et analyse d'images tels que ImageJ, des outils dédiés à l'histologie serait un plus.
- Capacité à communiquer en français et en anglais avec des publics variés (étudiants, ITA, chercheurs, commerciaux)
- Connaissances en métrologie
- Des connaissances en histologie sont bienvenues
- Des connaissances en biophysique/instrumentation sont bienvenues
- Connaissance des réglementations du domaine en hygiène et sécurité

Aptitudes
- Capacité à travailler en équipe, dynamisme, autonomie, envie d'apprendre
- Rigueur, sens de l'organisation.
- Goût du contact et de l'échange avec les ingénieurs du plateau technique et du partenaire industriel
- Capacité à s'insérer dans le dispositif général de la plateforme MRI

Contexte de travail

L'ingénieur-e sera en poste sur la plateforme Montpellier Ressources Imagerie (www.mri.cnrs.fr), une des 14 plateformes de l'UMS BioCampus (www.biocampus.cnrs.fr). Il / Elle sera intégré à l'équipe du plateau d'imagerie du campus CNRS route de Mende (MRI-CRBM). Il / Elle aura accès à l'ensemble des 15 équipements du plateau. Il /Elle sera particulièrement impliqué dans l'imagerie tissulaire aussi bien au plateau du CRBM que sur le plateau de l'INM sur lequel il y a deux scanners de lames. MRI développe un partenariat avec une entreprise régionale et la plateforme MDC, autre plateforme de BioCampus. Ils ont l'intérêt commun de tester et développer un scanner de lames dédié à l'imagerie histologique mais aussi aux échantillons de peignage moléculaire. Ce prototype sera situé sur le campus CNRS route de Mende. L'ingénieur-e interagira aussi avec la plateforme d'histologie de Montpellier (RHEM), également plateforme de l'UMS BioCampus.

Contraintes et risques

Contraintes de continuité de service.
Travail dans des pièces sombres.

Informations complémentaires

CDD d'1 an renouvelable 2 fois

Renseignements auprès d'Orestis Faklaris, responsable du plateau MRI-CRBM
Dépôt de candidature avant le 24/02/20 9h.

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