Ingénieur(e) d'étude en bioinformatique (H/F)

Nouveau

Laboratoire d'océanographie microbienne

BANYULS SUR MER • Pyrénées-Orientales

  • IT en contrat CDD
  • 12 mois
  • BAC+3/4

This offer is available in English version

Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.

L'offre en un coup d'oeil

L'unité

Laboratoire d'océanographie microbienne

Type de Contrat

IT en contrat CDD

Temps de Travail

Complet

Lieu de Travail

66651 BANYULS SUR MER

Durée du contrat

12 mois

Date d'Embauche

01/10/2026

Rémuneration

Entre 2496 et 3817, 32 € brut /mois selon expérience.

Postuler Date limite de candidature : lundi 8 juin 2026 23:59

Description du Poste

Les Missions

Nous recrutons un ingénieur (H/F) en bioinformatique. Ce projet concerne la caractérisation du Pan Génome de la microalgue phytoplanctonique Bathycoccus prasinos pour identifier dans l'océan, la structure des populations et les mécanismes d’adaptation à l’échelle spatio-temporelle.

L'Activité

L’activité principale consistera à assembler des données de séquençage issues de la technologie Oxford Nanopore d'une collection d’environ 150 génomes, puis à les intégrer dans des outils d’analyse et de visualisation du Pan génome.
Une seconde mission portera sur l’identification de marqueurs d’insertion/délétion (ins/del) propres aux différentes populations, suivie de leur cartographie sur des jeux de données de métagénomique et de métatranscriptomique environnementales de l'océan mondial.

Votre Profil

Compétences

Formation : Master en bioinformatique ou diplôme équivalent.
Le/La candidat(e) devra posséder de solides compétences en bioinformatique et en programmation (notamment en Python). Une expérience en assemblage et analyse de génomes, ainsi qu’en construction et analyse de Pan génomes, serait fortement appréciée.
Des qualités telles que la capacité d’adaptation, le sens du travail en équipe, la rigueur et l’autonomie sont également essentielles. La maîtrise de l’anglais scientifique est indispensable, tant pour la rédaction de rapports que pour les communications orales.

Votre Environnement de Travail

Le poste est à pourvoir au Laboratoire d’Océanographie Microbienne (LOMIC), situé à Banyuls-sur-Mer. L’activité se déroulera également au laboratoire DIADE situé à Montpellier, dans le cadre d’une collaboration menée via un projet financé par l’Agence Nationale de la Recherche.
Le LOMIC est reconnu comme un acteur majeur dans l’étude de la biologie et de l’écologie du picophytoplancton eucaryote. Le laboratoire DIADE, quant à lui, est pionnier dans le domaine des analyses pangénomiques et met à disposition des infrastructures informatiques de pointe, indispensables à la bonne conduite du projet.

Contraintes et risques

aucune

Rémunération et avantages

Rémunération

Entre 2496 et 3817, 32 € brut /mois selon expérience.

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

Référence de l’offre UMR7621-FRABOU-003
Secteur d’activité Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type Ingenieur biologiste en analyse de donnees (H/F)

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

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IT en contrat CDD • 12 mois • BAC+3/4 • BANYULS SUR MER

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