Missions

La personne recrutée participera aux expérimentations de terrain et de laboratoire du projet européen MICRORESCUE, et participera à des expériences en laboratoire, à l'analyse de données, à des travaux sur le terrain, et travaillera au sein d'une équipe de projet comprenant des doctorants et du personnel technique. Le CDD est proposé pour 1 an renouvelable pour maximum 3 ans.

Activités

Le post contribuera en particulier à differénts aspects :
- Étude/analyse des microbiomes du sol (expérimentale et observationnelle)
- Analyses bio-informatiques et statistiques des données de séquences de microbiomes
- Visualisation des résultats
- Travaux de laboratoire moléculaire et microbiologique
- Valorisation de la recherche : préparation de manuscrits pour publication, participation à des conférences scientifiques, etc.

Compétences

Compétences
• Connaissance pratique des cadres écologiques : dynamique des communautés/populations, écologie des perturbations, résilience et stabilité des systèmes, partitionnement temporel.
• Compétences avérées en matière d'analyses bioinformatiques et statistiques des données de séquence du microbiome
• Compétences en matière d'analyse : écriture et exécution de codes en R, GitHub ou similaire pour le contrôle des versions, calcul à haute performance
• Expérience de laboratoire en microbiologie (biologie moléculaire, bactériologie environnementale, 'omics/séquençage).
• Solides compétences en communication orale et écrite en anglais.
• Capacité à travailler de manière indépendante et flexible
• Capacité à travailler harmonieusement au sein d'une équipe.


Compétences ou expériences supplémentaires qui seraient considérées favorablement
• Familiarité avec la modélisation dynamique ou de séries chronologiques (communauté ou population), les analyses d'ensembles de données éparses ou d'autres compétences quantitatives dans les approches biogéographiques, phylogénomiques ou connexes.
• Expériences passées au sein d'un réseau de recherche écologique à long terme ou d'un réseau similaire
• Expérience de recherche dans le domaine des sols ou d'autres écosystèmes terrestres
• Sensibilisation aux normes de la science ouverte pour la recherche sur le microbiome (analyses reproductibles, conservation des métadonnées et dépôt de données publiques).

Contexte de travail

Le laboratoire d'Ecologie Microbienne, compte plus de 70 écologistes microbiens permanents qui collaborent au sein de sept équipes avec cinq plates-formes techniques permettant des analyses précises des activités microbiennes, des métabolites naturels et des génomes. Le candidat travaillera dans le cadre d'un projet européen

Contraintes et risques

Contraintes
Des déplacements sont possibles pour la collecte d'échantillons sur le terrain ou pour assister à des réunions scientifiques afin de valoriser les résultats.


- la procédure de candidature au poste
Les candidats doivent soumettre (en anglais) 1) un curriculum vitae à jour; 2) une lettre de motivation décrivant leurs intérêts et la manière dont leurs compétences et expériences correspondent aux besoins du poste; 3) les coordonnées de trois références professionnelles.