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H/F Ingénieur de recherche en traitement bioinformatique et analyse statistique de données de séquençage


Date Limite Candidature : mercredi 29 mars 2023

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Informations générales

Intitulé de l'offre : H/F Ingénieur de recherche en traitement bioinformatique et analyse statistique de données de séquençage
Référence : FR3743-MARAGU-002
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : TOULOUSE
Date de publication : mercredi 8 mars 2023
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 mai 2023
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Entre 2583.56 € et 2768.35 € brut mensuel selon l'expérience
Niveau d'études souhaité : Ingénieur
Expérience souhaitée : 1 à 4 années
BAP : Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en analyse de données

Missions

• Développer les méthodes d'exploitation, d'analyse de bases de données issues de la recherche en sciences du vivant, en assurer la valorisation et garantir la qualité et la validité des données produites et des traitements réalisés.
• Concevoir le plan d'analyse statistique, prendre en charge sa réalisation et assurer la validité des résultats
• Participer activement à la publication des résultats

Activités

• Mettre en place et optimiser les procédures de recueil et de contrôle des données
• Organiser la mise en forme et le stockage des données
• Réaliser le traitement des données et organiser la chaîne de traitement des données, de la collecte à l'analyse statistique
• Choisir et appliquer les méthodes statistiques existantes les plus pertinentes sur les données et déterminer les logiciels les mieux adaptés et les plus performants pour l'étude ou le projet en cours
• Développer des programmes spécifiques pour prendre en compte les particularités d'une étude statistique et adapter les applications informatiques aux besoins du projet
• Diffuser et valoriser des résultats sous forme de rapports techniques, Participer à la rédaction des synthèses de présentation des résultats des analyses statistiques
• Gérer et maintenir des outils informatiques partagés
• Conseiller et former aux techniques et outils développés. Effectuer des présentations pour assurer un transfert de compétences
• Apporter le conseil aux utilisateurs qui ont besoin de mettre en œuvre des méthodes et des outils statistiques
• Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité
• Participer à des actions de formation
• Participer à des réseaux professionnels, collaboratifs (en interne et en externe)
• Assurer un contrôle qualité sur les résultats produits
• Participer à l'interprétation, la mise en forme et la diffusion des résultats en collaboration avec les experts du domaine d'application
• Diffuser et valoriser les traitements statistiques développés

Compétences

​ Connaissances :
• Techniques informatiques de recueil, analyse et traitement des données
• Statistiques
• Langages de programmation (R, Python, bash)
• Biologie (connaissance générale) avec une expérience en données omiques
• Langue anglaise : écrit et oral ​

Compétences opérationnelles :
• Traiter des données
• Programmer dans différents environnements informatiques
• Interagir avec des biologistes et des informaticiens
• Garantir la qualité et la pertinence des outils d'analyse et des résultats, Rédiger la documentation pour les utilisateurs et Réaliser des synthèses
• Transmettre des connaissances et utiliser les techniques de présentation
• Assurer une veille
• Travailler en équipe

Contexte de travail

Le projet de recherche H2AZplice (financé par l'ANR) porté par Didier Trouche et son équipe de recherche a pour but de comprendre le fonctionnement des isoformes humains de H2A.Z dans l'épissage. Afin de répondre à cette question l'équipe de recherche aura recours à différente techniques de séquençage nouvelle génération pour étudier, entre autres, l'expression des gènes dans les cellules, les interactions entre les protéines et l'ADN et l'épissage.
L'équipe de recherche faisant partie du Centre de biologie intégrative (CBI) de Toulouse, le candidat travaillera en étroite collaboration avec la plateforme bioinformatique d'analyse des donnée génomique (big-A) du CBI sous la resposabilité de Marion Aguirrebengoa (responsable technique).

Contraintes et risques

Risque liés à un travail sédentaire sur écran