Ingénieur-e en synthèse chimique H/F

Description du Poste

Les Missions

Mettre en œuvre et exploiter des outils de chémo-informatique pour les projets scientifiques issus de criblage de la chimiothèque du laboratoire afin d'accélérer et de rationaliser la découverte de molécules bioactives, principalement au sein de la plateforme Chimiothèque mais aussi en appui aux équipes de l'unité « Chimie et Modélisation pour la Biologie du Cancer ».

L'Activité

1) Modélisation moléculaire :
- Effectuer des docking et criblages virtuels : aspect structural des biomacromolécules et des petits ligands, prédiction de complexes macromolécule(s)/ligand par IA génératives en absence de données structurales (AF, Boltz, Chai, etc).
- Participer au développement de méthodes de criblage virtuel des molécules de la chimiothèque et pour leur optimisation dépendant de la cible (« fragment-growing ») ou dépendant des propriétés moléculaires

2) Exploitation des données de la recherche :
- Analyser des données par des méthodes statistiques : SAR, QSAR, QSPR, calcul de descripteurs, analyse de diversité, recherche d'analogues, élaboration de bibliothèques virtuelles pour accélérer et rationaliser la découverte de molécules
- Mettre en œuvre des modèles d'apprentissage automatique (Machine Learning) et de grands modèles de langage (LLM) pour la prédiction des propriétés moléculaires, la sélection de nouveaux analogues et la proposition de voies de synthèse/rétro-synthèse.
- Participer à la veille scientifique sur les nouvelles méthodes et outils en chémoinformatique et intelligence artificielle (IA)

3) Chimiothèque :
- Participer à la gestion et à l'amélioration de la base de données de la chimiothèque (structure, informations chimiques, données biologiques associées)
- Maintenir et améliorer l'interface web de la chimiothèque, notamment par une meilleure inter-connectivité avec les bases de données nationales et internationales
- Participer aux activités de valorisation de la chimiothèque locale et nationale (via l'infrastructure de recherche ChemBioFrance)

Activités secondaires :
- Apporter un soutien à la gestion des ressources informatiques communes de la plateforme et de l'unité

Votre Profil

Compétences

Savoirs :
- Connaissances générales en chimie organique
- Connaissances en chimie médicinale (un atout : conception de molécules bioactives, relation structure-activité, optimisation de composés).
- Connaissances générales en informatique : Administration système (Linux), Langages de programmation (Bash, Python et/ou R), Langages de requête de type SQL, HTML, PHP
Anglais (écrit, oral) : Niveau B1 (cadre européen commun de référence pour les langues)

Savoir-faire:
- Maîtrise des outils et techniques de criblage virtuel (docking, pharmacomodulation) et de modélisation QSAR/QSPR
- Analyser des données, exploiter des bases de données
- Rédiger des documentations techniques

Savoir-être :
- Faire preuve d'autonomie
- Faire preuve de rigueur et de précision
- Organiser son travail selon les priorités et les objectifs
- Capacité à communiquer dans un environnement interdisciplinaire

Votre Environnement de Travail

L'unité "Chimie et Modélisation pour la Biologie du Cancer" (UMR9187/U1196), située au centre de recherche de l'Institut Curie à Orsay, est une structure interdisciplinaire dédiée à la conception et à la synthèse de sondes moléculaires et de candidats-médicaments anticancéreux, ainsi qu'à l'étude de leurs mécanismes d'action. Elle réunit 50 personnes et s'appuie sur :
- 3 équipes de recherche fondamentale,
- 2 pôles transversaux (modélisation et biologie),
- La plateforme "Chimiothèque", l¿une des plus importantes de France, avec près de 13 000 composés issus de 70 ans de recherche.

Le poste s'inscrit au sein de la plateforme "Chimiothèque" et du pôle modélisation de l'unité. L'ingénieur-e recruté-e collaborera étroitement avec :
- Les membres de la plateforme et les 3 équipes de l'unité,
- Les partenaires nationaux (IR ChemBioFrance) et internationaux.

L'ingénieur-e exerce ses fonctions sous la responsabilité de la direction de la plateforme « Chimiothèque » (IR CNRS) et s'intègre dans une dynamique collective visant à accélérer la découverte de molécules bioactives.

Pour faciliter l'intégration et l'adaptation au poste, un programme de formation interne sera proposé, incluant :
- Une initiation au machine learning et aux modèles LLM (Large Language Models), adaptée aux enjeux de la chimie et de la modélisation.
- Un accompagnement personnalisé en interne sur les outils et méthodes de modélisation, avec accès aux formations CNRS disponibles.
L'ingénieur-e bénéficiera également de l'écosystème collaboratif de l'infrastructure de recherche ChemBioFrance, et plus particulièrement du pilier ChémoInformatique, pour échanger avec des experts confrontés aux mêmes défis techniques et scientifiques.

Rémunération et avantages

Rémunération

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

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Les métiers de la recherche