Missions

Accompagner les équipes de recherche du laboratoire sur l'analyse des données, l'analyse d'images de microscopie et la mise en place d'outils de machine learning associés à ces analyses. Mettre en place et maintenir les outils informatiques nécessaires à ces analyses.

Activités

1 - Accompagner les projets scientifiques des chercheurs de l'unité autour de l'analyse des données.
- Identifier les méthodes de machine learning appropriées pour analyser les données expérimentales des projets de recherche du laboratoire
- Mettre en place une base de donnée des modèles de réseaux de neurones et des datasets (images) produits par le laboratoire. Les valoriser au sein de l'unité et de nos partenaires.
- Former et assurer le transfert technologique auprès des utilisateurs sur les différentes techniques utilisées.

2 - Mettre en place et assurer le développement du service commun d'analyse de données du laboratoire
- Accompagner les équipes dans l'achat et la maintenance de leurs équipements informatiques scientifiques (GPU, ressource de calcul externe, stockage interne et externe de large jeux de données).
- Réaliser une veille scientifique et technique permanente et assister et /ou participer à des manifestations scientifiques.
- Établir des liens étroits avec les autres laboratoires de l'Institut Curie et les laboratoires voisins.
- Assurer la surveillance et le suivi des ressources de stockage et de calcul de l'unité.

Compétences

Connaissances :
- Deep Learning (avancé)
- Analyse d'images (avancé)
- Programmation - Python (avancé)
- Statistiques et analyse de données

Savoir-faire :
- Mettre en oeuvre des solutions de deep learning pour l'analyse d'image
- Utiliser les logiciels spécifiques à l'activité (Environnements Conda, Python, GitHub, VSCode, Fiji, Napari,¿)
- Synthétiser et mettre en forme des résultats scientifiques (analyse de données)
- Assurer la maintenance du matériel informatique associé à l'activité.
- Rédiger des méthodes et des supports de formation.

Savoir-être :
- Pouvoir gérer de façon autonome l'organisation de son travail et s'adapter aux différents aspects des projets de recherche menés au laboratoire.
- Etre capable de travailler en équipe, être rigoureux et savoir être force de proposition.
- Avoir d'excellentes qualités d'écoute et savoir transmettre son savoir-faire.
- Goût pour l'interdisciplinarité et la biologie quantitative.
- Curiosité scientifique et technique.

Contexte de travail

L'activité s'exerce au sein de l'UMR 168 - Unité Physico Chimie Curie (CNRS/ Institut Curie/ SU). Cette unité rassemble une communauté de physiciens, chimistes et biologistes qui développent des approches interdisciplinaires pour approfondir notre connaissance des mécanismes cellulaires et des pathologies liées à leurs dysfonctionnements.
L'UMR168 est basée sur le campus parisien de l'Institut Curie à Paris 5ème. Elle compte 13 équipes de recherche et 2 services et ateliers communs, pour 160 personnes environ (1/3 permanents, 1/3 post-doctorants et 1
/3 doctorants).
L'ingénieur-e aura pour mission de créer un nouveau service pour accompagner les chercheurs de l'unité dans l'utilisation et le développement d'outils d'analyse, en particulier via les méthodes de deep learning.

Il/elle sera placé-e sous la responsabilité du Directeur de l'Unité.