Description du sujet de thèse

Les ribozymes ont une activité catalytique qui dépend de la nature d'ions divalents présents. Ce projet vise à rationaliser à l'échelle moléculaire l'origine de cet effet d'ions, à l'aide de simulations de dynamique moléculaire, classiques et mixtes quantique/classique, augmentées de corrections de type "machine learning". Un enjeu sera la mise au point de la procédure d'exploration du paysage réactionnel, la mise en place de la stratégie de correction, tout cela couplé à l'utilisation de méthodes d'échantillonage avancé.

Contexte de travail

L'Institut de Biologie Physico-Chimique offre un environnement exceptionnel aux scientifiques en début de carrière, avec une exposition internationale dynamique animée par des séminaires et réunions réguliers. Le Laboratoire de Biochimie Théorique (LBT) est reconnu internationalement pour le développement et l'application de méthodologies computationnelles pour résoudre des problèmes d'ordre biologique. Le laboratoire de Biochimie théorique abrite une quinzaine de permanents et autant d'étudiants, sur des thématiques variées de chimie et de biophysique théorique.

Contraintes et risques

N/A