Description du sujet de thèse

L'équipe ‘Tubulin Code’ travaille sur les modifications post-traductionnelles (PTMs) des tubulines qui modulent les propriétés des microtubules. L'équipe cherche à caractériser les enzymes qui génèrent ces PTMs et à comprendre le rôle physiologique de ces modifications en utilisant différents modèles tels que les cellules humaines en culture, les souris et la drosophile. A ce titre, l'équipe a récemment identifié de nouvelles enzymes modifiant les microtubules et une nouvelle PTM de la β-tubuline chez l'homme (1)

Le but de ce projet de thèse est de caractériser l'enzyme responsable et le rôle de la détyrosination de la tubuline α-pendant la gamétogenèse chez la drosophile. La détyrosination est une PTM conservée au cours de l'évolution modulant la dynamique et la stabilité des microtubules. Elle consiste en l'élimination du dernier acide aminé de la queue C-terminale de l'α-tubuline qui est exposée à la surface des microtubules. Deux familles de détyrosinases ont été identifiées chez les mammifères (1-4), mais aucune d'entre elles n'est conservée chez la drosophile. Nous avons récemment identifié l'enzyme générant la détyrosination de l'α-tubuline pendant la spermatogenèse chez la drosophile, qui représente une troisième classe de détyrosinases. Le premier objectif de ce projet est de caractériser le rôle de la détyrosination pendant la spermatogenèse en utilisant un mutant de l'enzyme de la drosophile que nous avons généré au laboratoire.

La deuxième partie du projet de doctorat consiste à étudier le traitement de l'α-tubuline pendant l'oogenèse de la drosophile. Cette partie du projet est réalisée en collaboration avec le groupe d'Antoine Guichet à l'Institut Jacques Monod (Paris). Notre objectif est d'identifier une enzyme responsable d'une autre PTM des microtubules pendant l'oogenèse en utilisant la biochimie et le criblage génétique.

Nous recherchons un(e) candidat(e) très motivé(e) avec une solide expérience en génétique et en biologie cellulaire. Une expérience avec le modèle de la drosophile est un plus. Les principales techniques utilisées pour ce projet sont : la biologie moléculaire et cellulaire, la biochimie, les essais in vitro, l'imagerie (y compris la microscopie d'expansion et l'imagerie à haute résolution) et la génétique de la drosophile.

Références :
1. Nicot, S. et al. A family of carboxypeptidases catalyzing α- and β-tubulin tail processing and deglutamylation. Sci. Adv. 9, (2023).
2. Aillaud, C. et al. Vasohibins/SVBP are tubulin carboxypeptidases (TCPs) that regulate neuron differentiation. Science 358, 1448–1453 (2017).
3. Landskron, L. et al. Posttranslational modification of microtubules by the MATCAP detyrosinase. Science 376, eabn6020 (2022).
4. Nieuwenhuis, J. et al. Vasohibins encode tubulin detyrosinating activity. Science 358, 1453–1456 (2017).

Contexte de travail

L’équipe ‘Tubulin Code fait partie de l'Institut de Génétique Humaine (IGH) qui est une unité mixte de recherche CNRS - Université de Montpellier (UMR 9002) dédiée à l'excellence dans la recherche fondamentale et l'étude des pathologies. Les principaux domaines de recherche de l'IGH sont la dynamique des génomes, la génétique du développement, l'épigénétique et la pathologie moléculaire et cellulaire. L'institut bénéficie d'un excellent environnement scientifique à Montpellier, comprenant de nombreux plateaux techniques. Nous disposons d'équipements de pointe, notamment en microscopie.
Voir www.igh.cnrs.fr/ pour plus de détails.

Le déroulement de la thèse est évalué annuellement par un Comité de Suivi Individuel (CSI).

L'IGH est situé sur le campus Arnaud de Villeneuve, partie prenante du programme Objectif Employeur Pro-Vélo.

Contraintes et risques

Parfois quelques heures de travail le week-end.