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Thése H/F: Effet de la tolérance aux agents antifongiques sur l'encombrement cytoplasmique

Cette offre est disponible dans les langues suivantes :
Français - Anglais

Date Limite Candidature : vendredi 6 août 2021

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Informations générales

Référence : UMR7277-ROBARK-008
Lieu de travail : NICE
Date de publication : vendredi 25 juin 2021
Nom du responsable scientifique : Robert Arkowitz
Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 15 septembre 2021
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : 2 135,00 € brut mensuel

Description du sujet de thèse

Le candidat mettra à profit une approche de microscopie sur cellules vivantes, récemment établie chez Candida albicans, un champignon pathogène opportuniste de l'Homme, pour quantifier l'encombrement cytoplasmique dans des souches ayant des tolérances aux antifongiques différentes, en utilisant une variété d'approches moléculaires et cellulaires.

Activité principale
Une bourse de thèse (3 ans) est disponible dans le groupe “Croissance polarisée chez la levure” à l'Institut de Biologie Valrose (iBV) de l'Université Côte d'Azur à Nice, FR (http://ibv.unice.fr/research-team/arkowitz/)

Notre équipe étudie la régulation spatiale et temporelle de la croissance filamenteuse en utilisant une variété d'approches de microscopie de pointe. La tolérance aux agents antifongiques est généralement décrite comme la survie ou la croissance des champignons au-dessus de concentrations inhibitrices; des sous-populations de C. albicans, capables de croître au-dessus de ces concentrations, ont été isolées. Cette tolérance, qui est une croissance lente en présence d'agent antifongique, dépend des voies de réponse au stress cellulaire. L'encombrement cytoplasmique est étroitement associé à l'abondance des protéines et organites, et donc affecté par des stress tels que la carence en nutriments; cet encombrement est vraisemblablement susceptible d'affecter également la tolérance aux agents antifongiques. L'objectif de ce projet collaboratif est de déterminer le lien entre tolérance aux agents antifongiques et encombrement cytoplasmique au niveau de la cellule. Le projet tirera parti d'approches d'imagerie de pointe, de génétique moléculaire et d'analyses d'images pour étudier la relation entre les caractéristiques physiques du cytoplasme et la tolérance antifongique dans les cellules individuelles et les communautés de C. albicans.

Objectifs:
-Déterminer l'hétérogénéité de l'encombrement cytoplasmique dans une population de cellules et s'il y a corrélation avec une tolérance aux agents antifongiques.
-Déterminer le lien entre concentration d'agents antifongiques intracellulaires et encombrement cytoplasmique.
-Quantifier l'encombrement cytoplasmique dans une variété de mutants de réponse au stress et d'isolats cliniques.

Les candidats doivent avoir un diplôme de Master ou équivalent dans un domaine pertinent.
Nous recherchons des candidats très motivés avec une formation en biologie cellulaire, microbiologie, microscopie et / ou biophysique - une expérience en imagerie sur cellules vivantes et analyse d'images est un plus. La motivation, l'enthousiasme, la capacité à communiquer en Anglais et à interagir avec les membres du laboratoire sont essentiels. Les candidats sont encouragés à contacter Robert Arkowitz (arkowitz@unice.fr).

Publications sélectionnées:
1. R. Abdul-Ganiyu, L. A. Venegas, X. Wang, C. Puerner, R. A. Arkowitz, B. K. Kay & D. E. Stone. Sci Signal, in press.
2. C. Puerner, N, Kukhaleishvili, D. Thomson, S. Schaub, X. Noblin, S. Seminara, M. Bassilana & R. A. Arkowitz. BMC Biol. 2020 18: 122. Actualité scientifique CNRS INSB: https://insb.cnrs.fr/fr/cnrsinfo/confinement-force-biophysique-de-linvasion-fongique
3. M. Bassilana, C. Puerner & R. A. Arkowitz. Curr Op Cell Biol. 2020 62:150.
4. R. A. Arkowitz & Bassilana M. F1000 Res. 2019 8.
5. P. M. Silva, C. Puerner, A. Seminara, M. Bassilana & R. A. Arkowitz. Cell Rep. 2019 28: 2231. Actualité scientifique CNRS INSB:
https://insb.cnrs.fr/fr/cnrsinfo/reinitialiser-la-polarite-cellulaire-sous-leffet-de-la-lumiere
6. A. Weiner, F. Orange, S. Lacas-Gervais, K. Rechav, V. Ghugtyal, M. Bassilana & R. A. Arkowitz. Cell Microbiol. 2019 21: e12963. Selected by Faculty 1000 December 18, 2018. https://f1000.com/prime/734234273?bd=1&ui=206550
7. H. Labbaoui, S. Bogliolo, V. Ghugtyal, N. V. Solis, S. G. Filler, R. A. Arkowitz & M. Bassilana. PLoS Pathogens. 2017 13: e1006205.
8. V. Ghugtyal, R. Garcia-Rodas, A. Seminara, S. Schaub, M. Bassilana & R. A. Arkowitz. PNAS USA. 2015 112: 8644.
9. S. G. Martin & R. A. Arkowitz. FEMS Microbiol Rev. 2014 38: 228
10. V. Corvest, S. Bogliolo, P. Follette, R. A. Arkowitz & M. Bassilana. Mol. Microbiol. 2013 89: 626.
11. A. Vernay, S. Schaub, I. Guillas, M. Bassilana & R. A. Arkowitz. J Cell Biol. 2012 198: 711. Selected by Faculty 1000 March 19, 2013. http://f1000.com/prime/717988257.

Contexte de travail

L'Institut de Biologie Valrose (28 équipes; 300 personnes; 25 nationalités) est un institut international (l'Anglais est la langue de travail) doté d'un environnement scientifique très riche. L'iBV fournit des infrastructures et plateformes technologiques de pointe, avec une atmosphère collaborative et vivante dans une ville/région très attirante. (ibv.unice.fr)

Contraintes et risques

Compétences
- Une expérience de travail avec les cellules fongiques est un plus mais n'est pas nécessaire.
- Expérience en microscopie.
- Sens de l'initiative et capacité à travailler de façon autonome.
- Capacité à travailler en équipe et à communiquer.
- Aptitude à accomplir un travail soigné et rigoureux.
- Capacité d'organisation et de traitement informatique des données.
- Facilité dans l'expression écrite et orale en Anglais.

Informations complémentaires

Il y a une certaine flexibilité en ce qui concerne le salaire du doctorat, en fonction des qualifications.

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