Description du sujet de thèse

Les cellules sensorielles situées autour du pôle aboral de la larve de l'hydrozoaire Clytia planula sont responsables des réponses aux signaux environnementaux, mais leur nature et leur fonction précises sont inconnues. Le candidat au doctorat établira un lien entre les différences dans la transcription des gènes entre les types de cellules sensorielles de Clytia planula et la morphologie, la fonction et l'histoire du développement. Il/elle caractérisera la structure et l'organisation de types spécifiques de cellules neurales et neurosensorielles de Clytia planula, en définissant leurs caractéristiques morphologiques distinctes par des techniques de microscopie optique en combinaison avec le vEM (collaboration avec d'autres boursiers du réseau/EMBL). Il/elle étendra les ensembles de données scRNA-seq pour trouver les moteurs et les effecteurs (i) de l'identité du type de cellule mature, (ii) de la morphologie, et (iii) de la spécification du destin, en déterminant la fonction des facteurs de transcription spécifiques identifiés par ces comparaisons, et des types de cellules correspondants, en utilisant des approches de knockdown de gènes. Il/elle collaborera avec les autres partenaires du réseau pour comparer le génotype/phénotype des types cellulaires entre les espèces.

Contexte de travail

Ce candidat au doctorat est recruté pour rejoindre le réseau doctoral Marie Sklodowska-Curie " ZooCELL : Tracing the evolution of sensory cell types in animal diversity : multidisciplinary training in 3D cellular reconstruction, multimodal data analysis and science outreach " qui implique des laboratoires de toute l'Europe (France, Allemagne, Italie, Pays-Bas, Suède et Royaume-Uni).
https://zoocell.eu/
Elle sera basée dans le laboratoire de biologie du développement de Villefranche-sur-mer. https://lbdv.imev-mer.fr/
Ils seront co-encadrés par Evelyn Houliston et Richard Copley, et inscrits à l'école doctorale "Complexité du Vivant" de Sorbonne Université.

Contraintes et risques

Exigence de mobilité de l'UE : Les candidats ne doivent pas avoir résidé ou exercé leur activité principale (travail, études, etc.) en France pendant plus de 12 mois au cours des 3 années précédant immédiatement la date de début du contrat.

Informations complémentaires

Les candidats doivent être fortement motivés par la remise en question des mécanismes et des concepts biologiques.

- Une formation et une expérience préalables en biologie cellulaire, moléculaire et du développement sont préférables.
Des compétences en bioinformatique seraient un avantage.
Niveau d'études requis : Maîtrise dans un domaine académique pertinent ou un diplôme permettant de s'inscrire à un doctorat dans le pays de délivrance. (Les candidats ne peuvent pas être déjà titulaires d'un doctorat).