Description du sujet de thèse

Chez les bactéries, la ségrégation de l'ADN repose principalement sur des systèmes de partition active, connus sous le nom de systèmes ParABS. Ces systèmes assurent la ségrégation fidèle des chromosomes et de la plupart des plasmides à faible nombre de copies. Les protéines ParA et ParB fonctionnent comme des interrupteurs moléculaires qui présentent des comportements collectifs. ParA forme des gradients dynamiques ou oscille sur le nucléoïde, tandis que ParB s'auto-assemble en un grand complexe nucléoprotéique au niveau du site centromérique, parS. Ce regroupement de ParB pourrait impliquer une séparation de phase, conduisant à la formation de condensats biomoléculaires.
Ce projet de doctorat vise à élucider les mécanismes moléculaires régissant le système ParABS par une approche intégrative et multidisciplinaire, combinant génétique, génomique, biologie cellulaire et biochimie, en collaboration avec des physiciens théoriciens. Plus précisément, nous caractériserons les interactions entre ParB clampé médié par le CTP, l'ATPase ParA, et l'apo-ParB (sans CTP). Le candidat développera des tests biochimiques pour capturer sélectivement l'état clampé de ParB et mettra en œuvre une stratégie basée sur l'optogénétique pour disséquer ces interactions au niveau moléculaire.
Cette étude apportera des informations importantes sur le mécanisme moléculaire de la partition de l'ADN et contribuera à une compréhension plus large de la séparation de phase et de la formation de motifs ParA impliqués dans la ségrégation de l'ADN bactérien.

Contexte de travail

Ce projet sera réalisé au CBI dans l'équipe Dynamique des Génomes Bactériens (GeDy) dirigée par Jean-Yves Bouet et François Cornet. Il s'inscrit dans le cadre dans le cadre d’une collaboration avec un groupe de physiciens théoriciens de l’Université de Montpellier, financé par l'ANR.

Contraintes et risques

Le poste ne comporte pas de contraintes spécifiques ni de risques particuliers.