Doctorant en Biologie des systèmes computationnelle / Bio-informatique (H/F)
Nouveau
- CDD Doctorant
- 36 mois
- Doctorat
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Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.
L'offre en un coup d'oeil
L'unité
Unité de biologie moléculaire, cellulaire et du développement
Type de Contrat
CDD Doctorant
Temps de Travail
Complet
Lieu de Travail
31062 TOULOUSE
Durée du contrat
36 mois
Date d'Embauche
01/10/2026
Rémuneration
La rémunération est d'un minimum de 2300,00 € mensuel
Postuler Date limite de candidature : mardi 19 mai 2026 23:59
Description du Poste
Sujet De Thèse
Le projet DigiTREAT est financé dans le cadre du programme PEPR Santé numérique (France 2030 – ANR) afin de développer le premier jumeau numérique médical multi-échelle dédié à la polyarthrite rhumatoïde (RA-DT). Le projet est coordonné par le professeur Anna Niarakis au Centre de Biologie.
Le/La doctorant(e) travaillera sur la construction et le calibrage d'un modèle générique multi-échelle intégrant des données omiques accessibles au public. Pour cela, il/elle devra :
- Analyser et intégrer des ensembles de données omiques issues de cellules individuelles et de populations.
- Développer des modèles computationnels prédictifs.
- Étalonner et valider des modèles computationnels à l'aide de données expérimentales.
- Améliorer des performances prédictives et de la précision biologique.
- Contribuer à la découverte de biomarqueurs.
La personne recrutée devra être titulaire d'un Master Bio-Informatique, Biologie Computationnelle ou dans un domaine connexe. Le projet requiert une expérience avec les données omiques (scRNA-seq et/ou bulk), des compétences en programmation : R, Python (la maîtrise de C++ est un atout), de solides compétences analytiques et interdisciplinaires, ainsi que la maîtrise de l'anglais.
Votre Environnement de Travail
Le projet DigiTREAT, financé par le programme PEPR Digital Health, vise à développer un jumeau numérique multi-échelle pour la polyarthrite rhumatoïde (PR) en intégrant la modélisation computationnelle, les données omiques et les cohortes cliniques. Le projet répond à un besoin clinique majeur non satisfait : prédire la réponse au traitement dans les maladies auto-immunes complexes.
Le poste est basé au Centre de Biologie Intégrative (CBI) de Toulouse, un centre de recherche commun au CNRS et à l'Université Toulouse III – Paul Sabatier dédié à la biologie intégrative à toutes les échelles. Le candidat rejoindra la division de biologie des systèmes et sera supervisé par le professeur Anna Niarakis.
https://cbi-toulouse.fr/en/equipe/pole-de-biologie-des-systemes-en/
Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.
Rémunération et avantages
Rémunération
La rémunération est d'un minimum de 2300,00 € mensuel
Congés et RTT annuels
44 jours
Pratique et Indemnisation du TT
Pratique et indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
À propos de l’offre
| Référence de l’offre | UMR5077-MARPEL1-021 |
|---|---|
| Section(s) CN / Domaine de recherche | Biologie moléculaire et structurale, biochimie |
À propos du CNRS
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
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