Doctorant ou doctorante en Neurooncologie Computationnelle (H/F)

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Unité de biologie moléculaire, cellulaire et du développement

TOULOUSE • Haute-Garonne

  • CDD Doctorant
  • 36 mois
  • BAC+5

This offer is available in English version

Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.

L'offre en un coup d'oeil

L'unité

Unité de biologie moléculaire, cellulaire et du développement

Type de Contrat

CDD Doctorant

Temps de Travail

Complet

Lieu de Travail

31062 TOULOUSE

Durée du contrat

36 mois

Date d'Embauche

02/11/2026

Rémuneration

La rémunération est de 2300,00 € brut mensuel

Postuler Date limite de candidature : mercredi 23 septembre 2026 23:59

Description du Poste

Sujet De Thèse

Les tumeurs tératoïde/rhabdoïde atypiques (AT/RT) sont des tumeurs pédiatriques agressives qui se manifestent dans le système nerveux central chez les très jeunes enfants. Elles sont causées par des mutations dans le gène suppresseur de tumeur SmarcB1 qui code pour une protéine du complexe de remodelage de la chromatine SWI/SNF. Les tumeurs AT/RT sont caractérisées par des modifications importantes de l’épigénome et du métabolisme cellulaire. L’objectif du projet de thèse est de caractériser la dynamique d’évolution de l’épigénome au cours du temps dans un modèle AT/RT basé sur la perte de fonction de SmarcB1 couplée à des altérations métaboliques dans les organoïdes cérébraux humains, en utilisant des approches computationnelles intégratives. Le ou la doctorante sera chargé de préparer les échantillons pour les analyses épigénomiques (ATAC-Seq, Cut&Run) et de réaliser les analyses computationnelles. Elle ou il sera intégré à deux équipes de recherche, l’une basée au CRCT pour la partie computationnelle (https://www.crct-inserm.fr/annuaire/vera-pancaldi/) et l’autre basée au CBI pour la partie expérimentale (https://cbi-toulouse.fr/equipe/davy/).
Nous recherchons un candidat ou une candidate titulaire d'un Master en biologie/bioinformatique très motivé(e), autonome et rigoureux(se). Une expertise en analyses computationnelles de l’épigénome est nécessaire et une première expérience en culture cellulaire serait un plus, ainsi qu’une familiarité avec les concepts de modélisation mathématique. Une capacité à communiquer à l’oral et à l’écrit en Anglais est indispensable afin de présenter les résultats dans le cadre du consortium PEPR Cell-ID ou d'autre évènements scientifiques.

Votre Environnement de Travail

Le ou la doctorante sera co-dirigée par Vera Pancaldi (CRCT INSERM) pour la partie computationnelle et par Alice Davy (CBI CNRS) pour la partie expérimentale. Le Centre de Biologie Intégrative (CBI) est l’un des sites majeurs de la recherche fondamentale en Biologie à Toulouse, il est situé sur le campus Rangueil de l’Université de Toulouse. Le Centre de Recherche en Cancérologie de Toulouse (CRCT) est un pôle de recherche majeur en cancérologie, il est situé sur le site de l’Oncopôle. Les deux instituts sont facilement accessibles par transport en commun.

Contraintes et risques

- Possibilité d’astreintes pour la culture cellulaire le week end et les jours fériés (maximum un jour par mois)

Rémunération et avantages

Rémunération

La rémunération est de 2300,00 € brut mensuel

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

Référence de l’offre UMR5077-ALIDAV-005
Section(s) CN / Domaine de recherche Biologie cellulaire, développement, évolution-développement

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

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Doctorant ou doctorante en Neurooncologie Computationnelle (H/F)

CDD Doctorant • 36 mois • BAC+5 • TOULOUSE

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