Missions

Contexte : Il est urgent de développer de nouvelles générations de composés antimicrobiens pour lutter contre la résistance microbienne. Les peptides antimicrobiens (PAMs), effecteurs essentiels de l'immunité de tous les organismes vivants, sont reconnus comme une alternative prometteuse contre la résistance aux antibiotiques, et comprendre, au niveau moléculaire, comment les PAMs fonctionnent dans la nature est la première étape essentielle vers l'ingénierie rationnelle de composés hautement efficaces.
Le projet ANR ANTARBioTic "Deciphering the mechanisms of action of the salt-insensitive king penguin defensins to fulfill the Global One Health Needs" se concentre sur la détermination du mécanisme d'action d'un peptide antimicrobien riche en ponts disulfure extrêmement prometteur, provenant du Manchot Royal. Dans ce projet, nous développons deux techniques biophysiques pour travailler avec des bactéries vivantes : la spectroscopie de fluorescence en temps réel (1) et la RMN à l'état solide (2). Le Dr. Céline Landon a apporté à Orléans une toute nouvelle expérience de spectroscopie de fluorescence en temps réel in vivo (sur bactéries vivantes), tandis que le DR. Dror Warschawski (à Sorbonne Université) a étendu l'approche RMN du deutérium à l'état solide à l'étude des cellules vivantes.
(1) C. Landon, Y. Zhu, M. Mustafi, J.-B. Madinier, D. Lelièvre, V. Aucagne, A. F. Delmas, J. C. Weisshaar "Real-Time Fluorescence Microscopy on Living E. coli Sheds New Light on the Antibacterial Effects of the King Penguin beta-Defensin AvBD103b". Int. J. Mol. Sci.,23:2057 (2022)
(2) V. Booth, D. E. Warschawski, N. P. Santisteban, M. Laadhari and I. Marcotte "Recent progress on the application of 2H solid-state NMR to probe the interaction of antimicrobial peptides with intact bacteria". Biochim. Biophys. Acta 1865:1500-1511 (2017)

Activités

Spectroscopie de fluorescence en temps réel et résonance magnétique nucléaire à l'état solide, pour l'étude des bactéries vivantes.
Le candidat retenu participera également à la supervision d'étudiants.
Mots-clés : Résistance microbienne, alternatives aux antibiotiques, peptides antimicrobiens (PAM), mécanisme d'action, biophysique, microbiologie, microscopie de fluorescence, RMN solide.

Compétences

Nous sommes actuellement à la recherche d'un candidat hautement qualifié et motivé ayant une expertise démontrée en microscopie de fluorescence (compétences essentielles) et en spectroscopie RMN sur des échantillons biologiques, avec un fort désir d'étendre ses compétences aux techniques de biophysique in vivo. Des compétences en culture cellulaire ou en microbiologie sont nécessaires.

Contexte de travail

Le Centre de Biophysique Moléculaire (CNRS, Orléans, France; htpps://cbm.cnrs-orleans.fr) développe des recherches à l'interface de la Chimie, de la Biologie et de la Physique qui s'intéressent aux mécanismes moléculaires du Vivant et aux dysfonctionnements qui conduisent au développement de certaines maladies.
Les projets du Laboratoire des biomolécules (LBM, Sorbonne Université, Paris, https://sciences.sorbonne-universite.fr/structures-de-recherche/lbm) sont essentiellement consacrés à la conception de nouvelles stratégies et/ou outils en chimie analytique, organique, inorganique, bio-organique, bio-inorganique, biophysique, biochimie, biologie et physiopathologie, afin d'observer, de comprendre, voire de contrôler les mécanismes fondamentaux du vivant, et d'analyser au niveau moléculaire les dysfonctionnements spécifiques associés aux pathologies humaines.
Le/la Post-doctorant(e) sera encadrée par le Dr. Céline Landon, responsable de l'équipe "RMN des Biomolécules : antimicrobiens, toxines et métabolites" au Centre de Biophysique Moléculaire. Les expériences de RMN du solides seront réalisées au LBM (Paris) sous la supervision du Dr. Dror Warschawski.
Pour la microscopie à fluorescence, le/la post-doctorant(e) aura facilement accès à la plateforme P@cyfic/MO2VING (CBM, CNRS, Orléans; http://cbm.cnrs-orleans.fr/en/mo2ving/pcyfic-cellular-imaging-and-flow-cytometry/. Pour les expériences de RMN du solide, il/elle aura accès à la plateforme RMN de l'Université de la Sorbonne, Paris; https://rmn.sorbonne-universite.fr/fr/index.html).
Le projet ANR ANTARBioTic "Deciphering the mechanisms of action of the salt-insensitive king penguin defensins to fulfill the Global One Health Needs" implique deux autres partenaires : Institut for Advanced BioSciences, Université Grenoble Alpes, Biopark Archamps, France, et Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien, Université de Strasbourg, France.

Contraintes et risques

Les missions du/de la post-doctorant(e) seront à effectuer majoritairement au CBM d'Orléans (2/3 du temps environ), avec des missions au LBM Paris, à 1 heure de train.