Chercheur postdoctoral: analyse bioinformatique des fonctions les lncRNA dans les plantes (H/F)
- Chercheur en contrat CDD
- 16 mois
- Doctorat
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Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.
L'offre en un coup d'oeil
L'unité
Institut de Biologie Intégrative de la Cellule
Type de Contrat
Chercheur en contrat CDD
Temps de Travail
Complet
Lieu de Travail
91198 GIF SUR YVETTE
Durée du contrat
16 mois
Date d'Embauche
01/04/2026
Rémuneration
Entre 3131€ et 3569€ bruts mensuels selon expérience
Postuler Date limite de candidature : mercredi 1 avril 2026 23:59
Description du Poste
Les Missions
Implémentation et utilisation de méthodes d'analyse de données RNA-seq et RIP-seq pour étudier les fonctions des lncRNA de plantes.
L'Activité
- Mettre en place des pipelines d'analyse de données NGS (RNA-seq et RIP-seq)
- Comparer des données transcriptome/RIP-seq inter-espèces
- Analyser les résultats en termes de fonctions évolutivement conservées
- Assurer le respect des principes FAIR des procédures informatiques
Votre Profil
Compétences
- Connaissances en biologie des ARN de niveau doctoral indispensables
- Outils et concepts bioinformatiques d'analyse NGS (genome/transcriptome/interactome)
- Maîtrise des langages Python et R
- Maîtrise d'au moins un gestionnaire de workflow
- Bonnes pratiques de bioinformatique
- Anglais niveau B1
- Sens du relationnel et de la communication
- Curiosité, dynamisme,
- Capacité à gérer de nombreuses interactions et à travailler sur des projets variés.
Votre Environnement de Travail
Dans le cadre d'un projet financé par l'ANR avec l'Institut des Sciences des Plantes Paris-Saclay (IPS2), nous étudions les fonctions des lncRNA végétaux au niveau moléculaire (role dans l'épissage, fixation aux protéines) et biologique (role dans la resistance à la sécheresse). A cette fin, nous disposerons de données RIP-seq pour plusieurs lncARN et RNA-seq, ceci pour 10 espèces de plantes. Nous utiliserons des méthodes bioinformatiques conventionnelles, mais également des méthodes par k-mers pour étudier la conservation de motifs de reconnaissances dans des régions globalement non conservées.
L'I2BC est un grand institut de biologie moléculaire et cellulaire situé dans un cadre agréable à 25km de Paris (Gif sur Yvette). Notre équipe (Biologie computationnelle des génomes) fait partie du département de Biologie des Génomes. L'environnement bioinformatique local est très riche: forum de discussion, séminaires et formations en bioinformatique, plateforme bioinformatique et centre de calcul de haute performance.
Rémunération et avantages
Rémunération
Entre 3131€ et 3569€ bruts mensuels selon expérience
Congés et RTT annuels
44 jours
Pratique et Indemnisation du TT
Pratique et indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
À propos de l’offre
| Référence de l’offre | UMR9198-DANGAU-011 |
|---|---|
| Section(s) CN / Domaine de recherche | Organisation, expression, évolution des génomes |
À propos du CNRS
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
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