Ingénieur en imagerie live de la traduction (H/F)

Job Description

Missions

Le SARS-CoV-2 est un virus à ARN simple brin de polarité positive responsable de la pandémie de COVID-19. Au cours de son cycle infectieux, il produit un ARN génomique et plusieurs ARN sous-génomiques qui possèdent des régions non traduites en 5′ (5′UTR) distinctes. Ces régions, composées d’une séquence Leader commune et de séquences variables spécifiques à chaque ARN viral, jouent vraisemblablement un rôle majeur dans la régulation de l’initiation de la traduction et dans la modulation des niveaux de production des protéines virales. Malgré leur importance potentielle dans le cycle viral, la contribution précise des différentes 5′UTR à la dynamique de la traduction et à l’expression différentielle des protéines du SARS-CoV-2 demeure encore insuffisamment caractérisée.
Sous la responsabilité du responsable de projet, la personne recrutée contribuera à un projet de recherche visant à déterminer le rôle des différentes régions 5′UTR du SARS-CoV-2 dans la régulation spatio-temporelle de la traduction des ARN viraux. Elle aura en charge la conception et la réalisation d’approches expérimentales combinant biologie moléculaire, production d’ARNm synthétiques, culture de cellules pulmonaires humaines et développement de systèmes rapporteurs permettant l’étude de la traduction en cellules vivantes. Elle participera à la mise en œuvre et à l’optimisation de techniques d’imagerie de la traduction en temps réel, au suivi de la dynamique traductionnelle à l’échelle de l’ARNm individuel, ainsi qu’à l’acquisition, au traitement et à l’analyse quantitative des données d’imagerie. Elle contribuera également à l’étude de l’impact de variations nucléotidiques des 5′UTR sur l’initiation de la traduction et sur l’expression des protéines virales, afin d’identifier les déterminants moléculaires impliqués dans la régulation de la synthèse protéique du SARS-CoV-2.

Activity

• Concevoir et produire des constructions rapporteuses et des ARNm synthétiques portant différentes régions 5′UTR du SARS-CoV-2.
• Mettre en œuvre des approches de biologie moléculaire (clonage, transcription in vitro, PCR, RT-qPCR, Western blot).
• Réaliser des expériences de culture et de transfection de cellules pulmonaires humaines.
• Développer et optimiser des approches d'imagerie de la traduction en cellules vivantes.
• Réaliser des acquisitions de microscopie de fluorescence et le suivi de la traduction en temps réel.
• Analyser et quantifier des données d'imagerie et de biologie moléculaire.
• Étudier l'impact de variations de séquence des régions 5′UTR sur l'initiation de la traduction et l'expression des protéines virales.
• Analyser, interpréter et présenter les résultats expérimentaux.
• Rédiger des rapports d'expériences et assurer la tenue du cahier de laboratoire.
• Participer aux réunions de laboratoire, à la veille scientifique et aux tâches collectives de l'équipe.

Your Profil

Skills

- Connaissances approfondies en biologie moléculaire des ARN et en régulation de la traduction chez les virus à ARN.
- Maîtrise des techniques de biologie moléculaire et de culture cellulaire (clonage, transcription in vitro, PCR, RT-qPCR, Western blot, transfection cellulaire).
- Connaissances en microscopie de fluorescence et en imagerie de cellules vivantes.
- Notions en analyse quantitative d'images et en traitement de données biologiques.
- Maîtrise des outils de bureautique et de logiciels d'analyse et de représentation des données scientifiques (GraphPad Prism, ImageJ/Fiji, logiciels de traitement d'images et d'analyse statistique).
- Connaissance des bonnes pratiques de laboratoire et rigueur dans la gestion et la traçabilité des données expérimentales.
- Capacité d'analyse, de synthèse et de résolution de problèmes expérimentaux.
- Autonomie, sens de l'organisation, rigueur expérimentale et aptitude à développer de nouvelles approches méthodologiques.
- Capacité à travailler en équipe et à interagir avec des collaborateurs multidisciplinaires.
- Maîtrise de l'anglais scientifique, à l'écrit comme à l'oral (niveau B2 minimum).

Your Work Environment

Le travail sera réalisé à l'Institut de Recherche en Infectiologie de Montpellier (IRIM, CNRS/Université de Montpellier), laboratoire international et interdisciplinaire dédié à l'étude des maladies infectieuses. L'IRIM dispose d'un environnement scientifique dynamique et d'un accès à des plateformes technologiques de pointe, notamment en microscopie et imagerie cellulaire. L'ingénieur(e) d'étude sera intégré(e) à l'équipe d'accueil et travaillera sous la responsabilité du responsable de projet.

Constraints and risks

Travail en laboratoire de biologie moléculaire et de culture cellulaire nécessitant le respect des règles de sécurité et des bonnes pratiques de laboratoire.

Compensation and benefits

Compensation

A partir de 2521€ brut mensuel ajustable en fonction de l'expérience professionnelle sur des postes de niveau équivalent

Annual leave and RTT

44 jours

Remote Working practice and compensation

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

About the offer

About the CNRS

The CNRS is a major player in fundamental research on a global scale. The CNRS is the only French organization active in all scientific fields. Its unique position as a multi-specialist allows it to bring together different disciplines to address the most important challenges of the contemporary world, in connection with the actors of change.

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