Ingénieure de recherche (H/F)
Nouveau
- IT en contrat CDD
- 12 mois
- BAC+5
Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.
L'offre en un coup d'oeil
L'unité
Institut Necker Enfants Malades - Centre de Recherche
Type de Contrat
IT en contrat CDD
Temps de Travail
Complet
Lieu de Travail
75015 PARIS 15
Durée du contrat
12 mois
Date d'Embauche
01/07/2026
Rémuneration
3237
Postuler Date limite de candidature : vendredi 22 mai 2026 23:59
Description du Poste
Les Missions
Mission principale La personne recrutée conduira des recherches en biologie computationnelle et bioinformatique, en étroite interaction avec des biologistes expérimentaux, afin d’analyser et d’intégrer des données single cell, multi omics et spatiales, et de développer des modèles permettant de décrypter la régulation génique médiée par les éléments rétrotransposables.
L'Activité
• Analyse de données single cell multi omics (scRNA seq, scATAC seq, multiome) issues de cellules immunitaires et cérébrales.
• Intégration de données de transcriptomique spatiale et d’imagerie avec des atlas single cell.
• Analyses à l’échelle d’atlas et intégration de cohortes publiques et internes.
• Développement de modèles statistiques et d’apprentissage profond pour l’étude de la régulation génomique et des éléments transposables.
• Développement, optimisation et maintenance de pipelines reproductibles (R, Python, Nextflow/Snakemake).
• Contribution à la rédaction d’articles scientifiques et à la valorisation des résultats.
Votre Profil
Compétences
Connaissances • Bioinformatique et biologie computationnelle.
• Analyse de données single cell et multi omics.
• Statistiques, apprentissage automatique et/ou deep learning.
Savoir-faire • Excellente maîtrise de R et Python.
• Développement de code propre, reproductible et documenté.
• Utilisation d’outils de gestion de versions (git).
• Expérience avec des pipelines de calcul (Nextflow, Snakemake ou équivalent)
Aptitudes • Forte curiosité scientifique et autonomie.
• Capacité à travailler en équipe interdisciplinaire.
• Rigueur scientifique, sens de l’organisation et esprit collaboratif.•
Votre Environnement de Travail
Le laboratoire développe un programme de recherche interdisciplinaire à l’interface entre biologie computationnelle, génomique fonctionnelle et immunologie. Les travaux portent sur le rôle des rétrovirus endogènes humains (HERVs) et autres éléments mobiles du génome dans la régulation de l’immunité humaine et des fonctions génomiques, en conditions physiologiques et pathologiques.
Les projets s’appuient sur des approches de pointe incluant le single cell et le spatial multi omics, l’intégration de cohortes à grande échelle, ainsi que le développement de modèles statistiques et d’apprentissage profond.
Contraintes et risques
Fort environnement interdisciplinaire et collaboratif.
• Accès à des jeux de données à grande échelle (single cell, multi omics, spatial).
• Accès à des infrastructures de calcul intensif (HPC).
• Laboratoire situé au centre de Paris, avec un environnement de travail attractif.
Rémunération et avantages
Rémunération
3237
Congés et RTT annuels
44 jours
Pratique et Indemnisation du TT
Pratique et indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
À propos de l’offre
| Référence de l’offre | UMR8253-LEADID-004 |
|---|---|
| Secteur d’activité | Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement |
| Emploi type | Ingenieur biologiste en analyse de donnees (H/F) |
| Expérience souhaitée | 1 à 4 années |
À propos du CNRS
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
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