Informations générales
Intitulé de l'offre : Contrat postdoctoral en génomique fonctionnelle des lncRNAs de macro algues brunes (H/F)
Référence : UMR8227-JERCOC-015
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail :
Date de publication : lundi 2 juin 2025
Type de contrat : Chercheur en contrat CDD
Durée du contrat : 27 mois
Date d'embauche prévue : 8 août 2025
Quotité de travail : Complet
Rémunération : De 2991.58€ à 4166.70€ brut par mois selon expérience
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : Indifférent
Section(s) CN : 23 - Biologie intégrative des organismes photosynthétiques et des microorganismes associés
Missions
Contrat postdoctoral en génétique moléculaire des algues brunes
Les algues brunes (Phaeophyceae), sont des macroalgues multicellulaires qui appartiennent au supergroupe eucaryote des Stramenopiles. Le projet ANR BrownLincs vise à approfondir la compréhension des processus moléculaires qui régissent le développement des algues brunes et l'acquisition de la multicellularité par l’analyse fonctionnelle du rôle régulateur des longs ARN non codants (lncRNAs), des acteurs clés de la régulation cellulaire dans le domaine Eukarya.
Le candidat ou la candidate déploiera la méthodologie CRISPR pour générer des délétions de plusieurs loci lncRNA sélectionnés dans l’algue brune modèle Ectocarpus. Les phénotypes des mutants ainsi obtenus seront ensuite analysés au niveau morphologique et moléculaire, ce dernier impliquant à la fois une analyse transcriptomique et une analyse de la chromatine par une approche ChIP-seq.
Activités
Le projet impliquera la maintenance et l’amplification de souches d'Ectocarpus de type sauvage et mutantes, l'application de la méthodologie CRISPR-Cas9 pour générer de nouvelles lignées mutantes et la caractérisation phénotypique de ces lignées mutantes. Le phénotypage utilisera une gamme d'approches différentes, incluant de la morphométrie, des approches de biologie cellulaire, et des approches transcriptomiques et épigénétiques. Des protocoles sont disponibles dans le laboratoire d'accueil pour toutes ces approches.
Compétences
Le candidat ou la candidate devra maitriser des approches standard de biologie moléculaire, de biologie cellulaire (microscopie) et posséder une solide connaissance des techniques CRISPR et/ou une expérience de la culture des macroalgues. Des compétences bio-informatiques, par exemple la capacité à analyser des données transcriptomiques, serait également appréciée.
Contexte de travail
L'institut d'accueil : La Station Biologique de Roscoff (SBR) est un centre de recherche en biologie marine et océanologie (http://www.sb-roscoff.fr/about-roscoff-marine-station/missions.html). Il est situé dans la ville de Roscoff sur la côte nord de la Bretagne, à environ 60 km à l’est de Brest. Le personnel de la SBR comprend environ 200 employés permanents.
Le poste est financé par l'Agence nationale de la recherche, au travers du projet Brownlincs. Il inclura des interactions fortes avec l'Institut de Biologie de l’Ecole Normale Supérieure (IBENS; UMR 8197) à Paris et l’Institut Génétique & Développement de Rennes (IGDR; UMR 6290) à Rennes.
Contraintes et risques
Pas de contrainte ni de risque spécifique