Postdoctorat en chimio-informatique et chimiométrie des maladies métaboliques par UHPLC -HRMS (H/F)
Nouveau
- Chercheur en contrat CDD
- 7 mois
- Doctorat
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Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.
L'offre en un coup d'oeil
L'unité
Multi-omique et physiopathologie des maladies métaboliques
Type de Contrat
Chercheur en contrat CDD
Temps de Travail
Complet
Lieu de Travail
59045 LILLE
Durée du contrat
7 mois
Date d'Embauche
01/06/2026
Rémuneration
Entre 3072 euros Brut et 4439 euros brut mensuel
Postuler Date limite de candidature : jeudi 9 avril 2026 23:59
Description du Poste
Les Missions
Un contrat de chercheur postdoctoral est ouvert à l’Unité METAB-OMICS, UMR 8199/1283 CNRS, INSERM, Institut Pasteur de Lille, CHU Lille, Université de Lille dans l’équipe “Métabolome, Microbiome et Maladies Métaboliques” et la plateforme de métabolomique IMPACT-PM supervisées par le Marc-Emmanuel Dumas, à Lille.
Le/la candidat(e) sélectionné(e) sera responsable du développement d’une suite chimioinformatique pour l’analyse du métabolome par spectrométrie de masse à haute résolution, en conjonction avec le génome et le métagénome.
Il/Elle contribuera au développement d’une base de données de spectres de masse de composés standards purs, et l’interfacer avec des spectres obtenus sur échantillons biologiques par le de fonctionnalités d’échantillonnage de pics, de recherche de masse, d’analyses statistique et des voies métaboliques.
L'Activité
L’objectif est de développer une méthodologie chimioinformatique d’analyse de données de spectrométrie de masse en métabolomique pour l’étude du microbiome humain et caractériser son rôle dans les maladies métaboliques.
Le/La candidat/e sera responsable de la mise en place de bases de données et de l’analyse des données de spectrométrie de masse générées par l’équipe:
• gestion des flux de données chimiques
• développement de méthodologies pour l’analyse de profils métabolomiques non-ciblés
• implémentation d’analyses statistiques et chimiométriques
• implémentation d’analyses de réseaux moléculaires par le biais de GNPS
• analyses chimioinformatiques (taxonomie chimique, empreintes MACCS, similarité chimique)
• analyses multi-omiques par chimiométrie, apprentissage automatiques analyses de médiation
Il/Elle sera responsable de l’analyse des données métabolomiques ainsi que la dissémination scientifique des résultats (rédaction d’articles scientifiques en Anglais, participations à des réunions et conférences internationales). Le/la candidat(e) jouera influencera le projet : design de la suite logicielle, optimisation et comparaison, définition des priorités, interprétation des résultats.
Votre Profil
Compétences
Le/la candidat(e) devra:
• être titulaire d’un Doctorat en chimio-informatique, chimiométrie ou chimie computationelle
• être expert dans l’analyse de données de spectrométrie de masse
• être expert dans l’attribution structurale automatisée de spectres de masse
• avoir une expérience de développement de bases de spectres dans des environnements variés
• avoir connaissance des statistiques unidimensionnelles et multidimensionnelles
• avoir connaissance des logiciels d’analyse chimiométrique
• avoir connaissance de l’exploitation du métabolome
• maitriser l’Anglais (écrit et parlé)
• être motivé par un projet d’équipe multidisciplinaire
• démontrer autonomie, rigueur, pensée critique, et capacité à s’intégrer au sein d’une équipe internationale
Votre Environnement de Travail
Le/la candidat-e sélectionné-e rejoindra l’équipe “Microbiome, Métabolome et Maladies Métaboliques” à l’UMR8199/1283 METAB-OMICS (directeur: Amélie Bonnefond) dont les objectifs de recherche sont d’étudier le microbiome pour identifier des métabolites microbiens impliqués dans le cardiométabolisme et étudier leurs bioactivités dans les processus biologiques. L’unité fournit un excellent environnement intellectuel et l’infrastructure requise pour le projet de recherche, avec un accès direct à des plateformes telles que la métabolomique par spectrométrie de masse haute résolution (IMPACT-PM), le séquençage à hauts-débits (LIGAN-PM, Équipement d’Excellence). En particulier, le/la candidat/e fera partie de l’équipe de Marc-Emmanuel Dumas. Le/la candidat/e travaillera en interaction avec des collègues au sein du groupe, de l’équipe, de l’unité et de collaborateurs internationaux, notamment avec Imperial College de Londres dans le cadre de l’Imperial–CNRS International Research Lab on Multiscale Metabolism.
Rémunération et avantages
Rémunération
Entre 3072 euros Brut et 4439 euros brut mensuel
Congés et RTT annuels
44 jours
Pratique et Indemnisation du TT
Pratique et indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
À propos de l’offre
| Référence de l’offre | UMR8199-HELDEG0-048 |
|---|---|
| Section(s) CN / Domaine de recherche | Physiologie, physiopathologie, biologie du cancer |
À propos du CNRS
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
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