Missions

La mission de ce postdoctorat consiste à développer des solutions pour l’intégration de multiples modalités biologiques et à établir un lien entre le phénotype observé au microscope et les différentes mesures moléculaires de la cellule. Les méthodes seront validées sur des données de criblage à haut débit, incluant des images microscopiques ainsi que des données d’expression génétique et protéomique. Ce principe sera ensuite appliqué à l’élucidation de fonctions géniques encore inconnues.

Activités

L’activité est principalement informatique. Elle concernera le développement de structure de modèles de réseaux de neurones profonds et leur entrainement. Elle consistera à étendre les résultats préliminaires que nous avons déjà obtenus dans le cadre de l’intégration de données d’imagerie microscopique avec des données transcriptomiques, grâce à la mise au point de variants de modèles de fusion de modalités.

Compétences

Doctorat en informatique, apprentissage profond, sciences des données. Expérience avec des modèles multimodaux pour les données biologiques.

Contexte de travail

Le postdoctorat se déroulera à mi-temps au sein de l’équipe de bioimagerie computationnelle et bio-informatique à l’IBENS, sous la direction d’Auguste Genovesio. Le/La postdoctorant.e aura accès à un poste de travail, ainsi qu’un accès à des serveurs de calculs équipés de GPUs.

Contraintes et risques

Aucune