Missions

Nous recherchons un candidat ou une candidate motivé(e) pour un contrat post-doctoral dans le groupe « Capri (Chimie Analytique, Physique-Chimie et Réactivité des Ions) de l'Institut de Chimie Physique (UMR 8000) à l'Université Paris-Saclay. Ce projet s'insère dans le cadre du contrat ANR/DFG international en collaboration avec le Deutsches Elektronen-Synchrotron DESY à Hambourg, Allemagne. Le projet, intitulé SAINBIOSIS, vise à l'étude des interactions entre les
atomes de soufre et les électrons de type pi des acides aminés aromatiques dans les peptides en utilisant des techniques spectroscopiques de pointe développées au sein du Laser à électrons libres CLIO à Orsay et sur les lignes de lumière (DESIRS et PLEIADES) du synchrotron Soleil et du synchrotron PETRAIII (P04) au DESY.

Activités

• Installation et couplage d’un spectromètre de masse de type piège à ions avec plusieurs sources de lumière dans l’IR, UV-VUV, rayons X au sein du laser à électrons libres CLIO, Synchrotron Soleil et PETRAIII en Allemagne ;
• Analyses des échantillons par spectrométrie de masse en piège à ions ;
• Analyses des échantillons par spectroscopie IR, VUV, de rayons X ;
• Irradiations des échantillons en utilisant une source au 60Co disponible au sein de l’ICP ;
• Interprétation des spectres par comparaison avec les calculs de chimie quantique.

Compétences

Nous cherchons un candidat ou une candidate qui a (ou aura bientôt) un doctorat et qui :

• possède une solide formation en physico-chimie moléculaire, spectroscopie optique et spectrométrie de masse ;
• a de l’expérience dans le couplage de lasers ou sources de lumière sur synchrotron avec la spectrométrie de masse (focalisation des sources de lumière, synchronisation)
• a de l'expérience avec l'analyse des spectres IR, VUV de molécules d’intérêt biologique.
• est innovant et aime résoudre les problèmes et repousser les limites des dispositifs de spectrométrie de masse ;
• aime travailler dans un environnement interdisciplinaire ;
• est créatif, enthousiaste, très motivé, capable de travailler de manière indépendante et en équipe ;
• est disponible à effectuer des séjours à Hambourg en Allemagne dans le cadre des campagnes expérimentales à DESY.
Des compétences avancées en communication en anglais sont indispensable en vue des interactions avec les collègues de DESY en Allemagne.

Contexte de travail

Des études de bio-informatique récentes basées sur des données des structures des protéines ont révélés qu’un tier de toutes les protéines connues ont leur structure stabilisée par des interactions non covalentes entre les atomes de soufre et les électrons π des groupes aromatiques : l’interaction S-pi. Suite à des modifications des orbitales moléculaires, les groupements impliqués dans l’interaction S-pi servent aussi comme station relais dans le processus de transport d’électrons au sein des protéines. La pertinence biologique de cette interaction est aussi due à son implication dans nombre de pathologies associées à la perte de l’interaction suite à l'oxydation des soufres, dont des maladies liées au vieillissement tel que Alzheimer et Creutzfeldt-Jacob. Les interactions S-pi gagnent actuellement en intérêt dans de nombreux secteurs de recherche, comme pour le développement de médicaments pour les thérapies ciblées, la création de catalyseur organique, ou encore la compréhension de la structure et de la fonction de systèmes moléculaires biologiques.
Aujourd’hui, cependant, il n’existe pas de données spectroscopiques permettant d’identifier l’interaction S-pi. Étudier cette signature non-seulement apporterait des informations sur la structure électronique, les transferts de charges et autres propriétés dérivées dans ces protéines, mais aussi constituerait un marqueur biologique de la dénaturation d’une protéine pour la détection précoce des pathologies liés à la perte de cette interaction. Dans le cadre de ce projet, nous allons employer des méthodes spectroscopiques modernes (spectroscopie infra-rouge, UV, VUV, de rayons-X), en combinaison avec des techniques de pointe en spectrométrie de masse, pour identifier et caractériser l’interaction S-pi dans des peptides et des protéines. Les effets de l’oxydation des soufres sur la dénaturation des protéines, ainsi que les modifications de la signature spectroscopique seront aussi étudiés.
Il s’agit d’un nouveau projet dans le cadre d’un contrat ANR/DFG international SAINBIOSIS entre l'Institut de Chimie Physique à l'Université Paris-Saclay et DESY en Allemagne. Le groupe en Allemagne est spécialisé dans la spectroscopie d’ions biomoléculaires dans les domaines VUV et rayons X.
L’Institut de Chimie Physique (ICP) est une UMR CNRS-Université Paris-Saclay. Il est composé de 85 permanents et d’une cinquantaine de non-permanents à la Faculté des Sciences de l’Université Paris-Saclay. Ses activités de recherche sont organisées en 4 groupes scientifiques. Les activités de recherche de l’ICP sont ancrées en Chimie, avec des projets interdisciplinaires, aux interfaces avec la Physique et les Sciences du Vivant. L’ ICP dispose de plateformes scientifiques aux caractéristiques uniques dont CLIO (Centre Laser Infrarouge d’Orsay), un Laser à électrons libres (LEL) dans l’infrarouge et SMAS (Spectrométrie de masse, Analyse et Spectroscopies) qui est une plateforme de spectrométrie de masse couplée aux lasers IR CLIO et un système OPO/OPA (Optical Parametric Oscillator/Optical Parametric Amplificator) permettant aux chercheurs français, européens et internationaux d’accéder à ses moyens expérimentaux de pointe. Une ingénieure d’étude et un assistant ingénieur sont dédiés à ces plateformes. Les chercheurs travaillant sur la plateforme SMAS développent depuis 20 ans la spectroscopie d’ions infra-rouge basée sur la combinaison de lasers infra-rouge et de spectromètres de masse. La plateforme SMAS fait partie de l’Infrastructure de recherche nationale Infranalytics et du nouveau PEPR exploratoire LUMA. L'équipe est très interactive et dynamique, et le candidat ou la candidate aura l'opportunité de collaborer sur d'autres projets en cours en fonction de ses intérêts et dans le cadre de ses Infrastructures de Recherche.

Contraintes et risques

Contrat initial d’1 an renouvelable une fois.