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Chercheur postdoctoral (H/F): Conception et implémentation de méthodes hybrides combinant l'analyse d'images de cryo-microscopie électronique et la modélisation de la dynamique moléculaire

Cette offre est disponible dans les langues suivantes :
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Informations générales

Référence : UMR7590-SLAJON-002
Lieu de travail : PARIS 05
Date de publication : lundi 4 novembre 2019
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 18 mois
Date d'embauche prévue : 1 février 2020
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Entre 2695 et 3841€ bruts mensuels selon expérience
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

Le chercheur postdoctoral travaillera sur le développement d'algorithmes et de software pour combiner des méthodes de modélisation de la dynamique moléculaire (analyse de modes normaux et simulation de la dynamique moléculaire) avec des méthodes d'analyse d'images de cryo-microscopie électronique, dans le contexte d'étude de changements conformationnels continus des complexes biomoléculaires. Les nouvelles méthodes seront basées sur les méthodes développées précédemment dans l'équipe (https://doi.org/10.1016/j.str.2014.01.004 ; https://doi.org/10.1016/j.jsb.2014.09.005; https://doi.org/10.1016/j.sbi.2016.12.011).

Activités

Tâches principales :
- Concevoir des algorithmes et les implémenter
- Concevoir des expériences avec des données synthétiques pour tester des nouvelles méthodes
- Utiliser des nouvelles méthodes pour analyser des données expérimentales fournies par des collaborateurs
- Rédiger des articles scientifiques
- Participer à des conférences scientifiques et réunions avec des collaborateurs internes et externes (réunions physiques et à distance)

Compétences

- Doctorat en Informatique, Mathématiques Appliqués, Physique, etc.
- Fortes compétences en programmation
- Expérience en développement de méthodes de traitement d'images ou en développement de méthodes de modélisation de la dynamique moléculaire (e.g., analyse de modes normaux ou simulation de la dynamique moléculaire)
- Bonnes aptitudes interpersonnelles
- Bonnes compétences en communication orale et écrite
- Créativité
- Intérêt pour l'analyse des données de biologie structurale

Contexte de travail

Ce travail sera réalisé dans le contexte d'un projet financé par l'ANR, à l'Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie (IMPMC-UMR 7590, Sorbonne Université, 75005 Paris). L'IMPMC est une unité mixte de recherche CNRS - Sorbonne Université - Muséum National d'Histoire Naturelle qui compte environ 200 membres. Le laboratoire est fortement pluridisciplinaire, composé de chercheurs, enseignants-chercheurs, et ingénieurs issus des disciplines différentes (physique, science de la Terre, biologie, chimie, informatique, etc.). Des thèmes divers de recherche expérimentale et théorique y sont traités tel que l'élucidation de la structure des matériaux et des assemblages macromoléculaires, investigation de leurs propriétés dynamiques, étude des interactions entre le vivant et le minéral, etc.

Contraintes et risques

Durée de contrat: 18 mois, avec possibilité d'extension.

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