Missions

Le candidat analysera des données de CRISPR-screen et scRNA-seq générées par l'équipe chez des patients atteints d'hémopathies maligne afin de modéliser l'hétérogénéité cellulaire, explorer la dynamique des cellules malignes en lien avec le microenvironnement et l'impact de therapies ciblées . Il contribuera à décrypter les mécanismes biologiques à l'origine de la résistance à la thérapie.

Activités

Contribuer à un programme de recherche visant à analyser, intégrer et interpréter des données génomiques à grande échelle, en mettant l’accent sur les données issues de séquençage d’ARN sur cellule unique. Mettre en oeuvre et développer des nouvelles méthodes statistiques et des pipelines automatisées pour analyser et visualiser de larges jeux de données de séquençage haut-débit. Analyser et interpréter les résultats, communiquer avec les collaborateurs et produire des publications scientifiques.

Compétences

Maîtrise de la programmation en R ainsi que des outils assurant une reproductivilité des analyses (Docker) et la gestion de version (git..), Connaissance en administration système sous Unix/Linux, Shell. maîtrise des méthodes mathématiques d'analyse de données multidimensionnelles (ACP, t-SNR, UMAP), assurer une veille scientifique des méthodes d'analyse, dynamisme, autonomie, esprit d'équipe, adaptabilité, maîtrise de l'anglais scientifique écrit et oral

Contexte de travail

Déplacements en congrés nationaux et internationaux possibles

Contraintes et risques

Travail sur ordinateur.