PostDoc H/F, Bioinformaticien expert en transcriptomique spatiale (neurobiologie)
Nouveau
- Chercheur en contrat CDD
- 12 mois
- Doctorat
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Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.
L'offre en un coup d'oeil
L'unité
Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire
Type de Contrat
Chercheur en contrat CDD
Temps de Travail
Complet
Lieu de Travail
06560 VALBONNE
Durée du contrat
12 mois
Date d'Embauche
01/07/2026
Rémuneration
entre 3072,00 € et 4258,00 € bruts mensuels selon expérience
Postuler Date limite de candidature : lundi 18 mai 2026 23:59
Description du Poste
Les Missions
Choisir, développer et mettre en œuvre un pipeline standardisé pour l’analyse de données de spatiales transcriptomiques (10XGenomics Xenium) dans un contexte de recherche en neurobiologie (coupe de cerveau de souris). Le/la candidat(e) mènera trois projets en parallèles pour trois équipes de recherche de l’IPMC. Ce projet comporte une dimension de développement méthodologique visant à implémenter des solutions innovantes pour l’études des ARNs au niveau subcellulaire (projections neuronales) majoritairement éludés par les solutions bioinformatiques standards actuelles.
L'Activité
Choix et adaptation des protocoles d’analyse des données de transcriptomique spatiale dans le cadre des projets scientifiques réalisés, mise en œuvre des analyses et contrôles qualité
Rédaction / mise à jour des rapports d'études, conduites de réunions de projets régulières
Rédaction d’articles scientifiques, figures, méthodes
Participation à la veille scientifique et technologique du domaine
Implémentation d’un package python pour la mise en œuvre d’analyse subcellulaire en application aux thématiques étudiées dans les projets de recherches des équipes.
Votre Profil
Compétences
Connaissances en biologie moléculaire et cellulaire et en génomique
Capacités à comprendre la biologie des systèmes étudiés
Expert en développements python et en statistiques
Capacité à travailler en étroite collaboration avec les collaborateurs biologistes.
Aptitude à la communication orale et écrite (français/anglais).
Votre Environnement de Travail
Expérience opérationnelle sur serveurs Unix/Linux.
Maitrise des logiciels d'analyse statistique (Python, R).
Bonnes connaissances en biologie.
Aptitude à la communication orale et écrite (français/anglais).
Capacité au travail en équipe, dans le cadre de multiples collaborations avec des chercheurs, doctorants, post-doctorants, ingénieurs.
Capacité d'initiative dans l'organisation générale et quotidienne.
Le poste est à pourvoir au sein de l'Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire à Sophia Antipolis (Alpes Maritimes). L'IPMC regroupe 21 équipes de recherche et des services communs pour un effectif global de plus de 250 personnes. La personne recrutée sera localisée sur le hub de bioinformatique de l’IPMC, regroupant 8 bioinformaticiens experts en analyse de transcriptomique spatiale. Il travaillera en étroite collaboration avec les trois équipes de recherche impliquées et aura pour mission de mener à bien les projets de recherche en transcriptomique spatiale de ces équipes.
Rémunération et avantages
Rémunération
entre 3072,00 € et 4258,00 € bruts mensuels selon expérience
Congés et RTT annuels
44 jours
Pratique et Indemnisation du TT
Pratique et indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
À propos de l’offre
| Référence de l’offre | UMR7275-KEVLEB-002 |
|---|---|
| Section(s) CN / Domaine de recherche | Modélisation mathématique, informatique et physique pour les sciences du vivant |
À propos du CNRS
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
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