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Portail > Offres > Offre UMR6074-DOMLAV-002 - Ingénieur d'Etude en biotechnologie H/F

Ingénieur d'Etude en biotechnologie H/F

Cette offre est disponible dans les langues suivantes :
Français - Anglais

Date Limite Candidature : mardi 29 juin 2021

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Informations générales

Référence : UMR6074-DOMLAV-002
Lieu de travail : RENNES
Date de publication : mardi 8 juin 2021
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 24 mois
Date d'embauche prévue : 12 juillet 2021
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : entre 2088 et 2400 Euros bruts mensuels selon experience
Niveau d'études souhaité : Bac+5
Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

La mission de l'Ingénieur d'Études s'inscrit dans le cadre du projet dnarXiv (https://project.inria.fr/dnarxiv/). Il aura pour mission de développer l'ensemble des approches biologiques amont et aval du programme dnarXiv. C'est-à-dire, de mettre au point en amont, la synthèse longue des ADN. Coté aval, l'IE aura pour mission de réaliser les séquençages des molécules produites par la technologie Nanopore et d'effectuer le traitement bioinformatique des données résultantes

Activités

• Définir un ensemble cohérent de techniques de biologie moléculaire nécessaires à la réalisation expérimentale du projet scientifique en tenant compte des contraintes des collaborateurs informaticiens/bioinformaticiens associés
• Concevoir le développement et conduire en spécialiste, la réalisation de la production des molécules d'ADN dédiées au stockage d'information puis à la préparation des banques d'ADN pour séquençage. Réaliser les séquençages et leurs analyses primaires en bioinformatique
• Conseiller, dans le cadre de ce projet, les partenaires non-biologistes afin de définir les contraintes de biologie s'appliquant au projet, les options techniques ; évaluer et valider les choix en concertation
• Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques
• Former, en interne et en externe, aux principes et à la mise en œuvre des techniques de l'expérimentation en biologie les éventuels stagiaires
• Assurer une veille scientifique et technologique dans le domaine des technologies de stockage de l'information sur ADN
• Gérer les moyens techniques et financiers alloués aux activités d'expérimentation

Compétences

Connaissances
• Biologie moléculaire des acides nucléiques, clonage, séquençage haut débit, réalisation de banques et séquençage
• Réglementation en matière d'hygiène et de sécurité
• Des connaissances informatiques en analyse de données de séquençage haut débit sont requises
• Langue anglaise : B2 à C1 (cadre européen commun de référence pour les langues)
Compétences opérationnelles
• Concevoir des dispositifs expérimentaux
• Développer une expertise scientifique et technologique dans le domaine de la production et de l'analyse de séquences ADN à vocation de stockage d'information
• Utiliser les logiciels spécifiques à l'activité
• Rédiger des documents scientifiques
Formation
• Ecole d'ingénieurs, master
Domaine de formation
• biologie moléculaire des acides nucléiques,
• biotechnologie
• bioinformatique

Contexte de travail

L'IRISA (Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires) est aujourd'hui l'un des plus grands laboratoires de recherche français (+ de 850 personnes) dans le domaine de l'informatique et des nouvelles technologies de l'information. Structuré en sept départements scientifiques, le laboratoire constitue un pôle de recherche d'excellence avec des priorités scientifiques telles que : la bio-informatique, la sécurité des systèmes, les nouvelles architectures logicielles, la réalité virtuelle, l'analyse des masses de données et l'intelligence artificielle.
Le candidat sera rattaché principalement à l'équipe GenScale, IRISA, Beaulieu, Rennes (D. Lavenier), mais une partie de la mission s'effectuera à l'IGDR, Villejean, Rennes, dans l'équipe GED (Y. Audic)
GenScale est une équipe de recherche en bioinformatique. Son objectif principal est de développer des méthodes, des outils et des logiciels évolutifs pour le traitement des données génomiques. Les recherches sont motivées par le développement rapide des technologies de séquençage de nouvelle génération (NGS) et de troisième génération (TGS) qui posent des problèmes très difficiles tant en termes de bioinformatique que d'informatique.
L'équipe "Gene expression and development" (GED) étudie les régulations post-transcriptionnelles, en utilisant essentiellement comme modèles l'amphibien xénope, les cellules en culture et la souris. Ces recherches ont un fort impact pour la compréhension de certaines pathologies chez l'humain.
Pour ces 2 équipes, le projet dnarXiv représente un nouvel axe de recherche.

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