Ingenieur d'étude (H/F) barcoding/métabarcoding de pathogènes émergents aquatiques
- IT en contrat CDD
- 12 mois
- BAC+3/4
Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.
L'offre en un coup d'oeil
L'unité
Centre de Recherche sur la Biodiversité et l'Environnement
Type de Contrat
IT en contrat CDD
Temps de Travail
Complet
Lieu de Travail
31062 TOULOUSE
Durée du contrat
12 mois
Date d'Embauche
02/03/2026
Rémuneration
entre 2496€ et 2662€ brut mensuel selon expérience
Postuler Date limite de candidature : lundi 16 février 2026 23:59
Description du Poste
Les Missions
La personne sélectionnée jouera un rôle central dans le projet AQUAPAT. Ce projet vise à développer des outils opérationnels utilisant de nouvelles technologies moléculaires pour réaliser une surveillance simultanée et précise des pathogènes et de leurs hôtes compétents. Il prévoit également la réalisation d'une cartographie fine des zones critiques où les conditions environnementales locales favorisent l'émergence des pathogènes. En adoptant une approche proactive et holistique, le projet vise à améliorer la surveillance, le diagnostic et la gestion des maladies infectieuses, en fournissant des solutions concrètes et efficaces pour répondre aux défis posés par les pathogènes dans les écosystèmes aquatiques.
Le projet se structure autour de 2 axes :
i) Développement de nouveaux outils basés sur l'ADNe/ARNe et la dPCR pour améliorer la surveillance des pathogènes d’eau douce
ii) Etude du pathogène émergent Tetracapsuloides bryosalmonae, agent de la PKD, développement de marqueurs moléculaires et utilisation du métabarcoding pour caractériser le complexe d’espèces hôtes Bryozoaires
L'Activité
-Travail terrain : échantillonnage en milieu aquatique, prélèvements ADNe/ARNe
-Extractions ADN/ARN
-PCRs digitales / métabarcoding par PCR pour séquençage Illumina
-Mise au point ou ajustement de protocoles existants
Votre Profil
Compétences
- Des compétences préalables sur la manipulation de pathogènes seront obligatoires
- Une très bonne expérience de terrain sur l’échantillonnage ADNe/ARNe est requise (filtration, transport)
- Une expérience de terrain en milieu difficile est requise (terrain en montagne dans les Pyrénées)
-Biologie moléculaire : solides compétences en extraction d’ADN/ARN, dPCR, multiplexage
-Savoir suivre un protocole
-Savoir adapter un protocole de biologie moléculaire
Votre Environnement de Travail
La personne recrutée sera basée au Centre de Recherche sur la Biodiversité et l'Environnement (CRBE) situé à Toulouse sur le campus de l'Université de Toulouse - Paul Sabatier. Elle travaillera à la plateforme B2M du CRBE et effectuera du terrain dans les rivières et lacs du bassin Adour-Garonne (y compris des sites en montagne dans les Pyrénées).
Rémunération et avantages
Rémunération
entre 2496€ et 2662€ brut mensuel selon expérience
Congés et RTT annuels
44 jours
Pratique et Indemnisation du TT
Pratique et indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
À propos de l’offre
| Référence de l’offre | UMR5300-GERLOO-002 |
|---|---|
| Secteur d’activité | Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement |
| Emploi type | Ingenieur biologiste en laboratoire (H/F) |
À propos du CNRS
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
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