Missions

L’ingénieur/ ingénieure réalisera des analyses protéomiques et des analyses de caractérisations structurales de protéines, sur différents spectromètres de masse présents sur la Plateforme Protéomique de l’Institut de Microbiologie de la Méditerranée (IMM) de Marseille Protéomique (MaP), réseau de plateformes protéomiques marseillaises, labellisé IBiSA et Aix- Marseille Université, et certifié Norme ISO-9001 et NFX-50900 depuis juin 2024. L’ingénieur/ ingénieure participera ainsi aux diverses activités réalisées sur la Plateforme MaP-IMM. Un investissement particulier sera porté sur un projet d’étude de l’impact de l’alarmone ppGpp dans l’adaptation des plantes et des bactéries en relation avec des changements environnementaux qui sont un problème actuel de plus haute importance pour la société (ANR targetG4P).

Activités

- Réaliser des analyses de protéomique classique ou avec quantification relative label free ou après marquage isotopique, par spectrométrie de masse haute résolution (MS) (équipement actuel : Q-Exactive + couplé à une nano-chromatographie liquide Neo Vanquish)
- Mettre en œuvre des méthodes pour l’étude d’interactomes par Cross-linking et MS
- Réaliser des mesures de masses globales de protéines purifiées, par spectrométrie de masse MALDI-ToF ou electrospray- Q-ToF en conditions natives ou dénaturantes
- Réaliser les traitements bio-informatiques associés aux données scientifiques acquises par divers logiciels spécifiques
- Rédiger des rapports d’analyses, compléter des tutoriaux
- Se tenir au courant des développements en spectrométrie de masse et des logiciels associés
- Participer à la maintenance des instruments scientifiques
- Suivre et mettre à jour les procédures de la Norme ISO-9001 et NFX-50900 mises en place dans le réseau MaP

Compétences

- Avoir des connaissances théoriques et pratiques en biochimie des protéines
- Avoir des connaissances théoriques et pratiques en spectrométrie de masse et en chromatographie liquide
- Savoir s’organiser dans un travail multi-tâches : suivre un plan d’expériences, collecter des résultats et savoir rédiger le cahier de laboratoire, un rapport ou un tutorial
- Savoir agir avec rigueur dans la gestion de centaines d’échantillons, avec le respect d’un cahier des charges
- Savoir communiquer et travailler en équipe
- Savoir mener une veille scientifique
- Connaître l’environnement bureautique (stockage/archivage de données) et maîtriser les logiciels bureautiques courants (Excel, Word, Powerpoint…)
- Connaissance de l’anglais technique et scientifique

Contexte de travail

L’activité s’exerce au sein de l’Institut de Microbiologie de la Méditerranée (IMM), Fédération de Recherche FR3479, composé de 4 UMR (BIP, IGS, LCB, LISM, environ 300 personnes) localisé sur le site du Campus Joseph Aiguier de la Délégation du CNRS à Marseille (9e). La Plateforme de MaP-IMM est composée de 3 ingénieurs dont la responsable technique Régine Lebrun, à contacter pour cette offre: rlebrun@imm.cnrs.fr. MaP-IMM a la perspective de faire évoluer son parc de spectromètres de masse vers une nouvelle génération pour 2025.