Missions

L'Ingénieur/ L'ingénieure renforcera la plateforme de microscopie photonique hébergée au sein de l'Institut de Biologie du Développement (IBDM) à Marseille. La mission principale de l'agent sera de participer activement à la mise en place de nouvelles méthodes d'imagerie selon les axes de développement de la plateforme, à savoir la microscopie confocale, et les méthodes d’imagerie automatisée allant de l’acquisition au traitement des images. Il contribuera aussi au fonctionnement optimal des 21 systèmes d'imagerie de la plateforme et à l'assistance des utilisateurs dans leurs besoins d'imagerie. Il assurera la formation de ces derniers sur les différents dispositifs et suivra les projets des utilisateurs.

Activités

Accueillir et former des utilisateurs sur les systèmes d'imagerie de la plateforme.
Contribuer à la métrologie des systèmes dont il/elle a la responsabilité.
Contribuer au développement de nouvelles méthodologies et de rédaction de documents techniques sur les nouveaux instruments
Prendre en charge des activités de suivi de projets scientifiques : aide à la réalisation d'expériences, interprétation et rédaction de rendus de résultats.
Prendre part aux activités de réseau (RTmfm, GDR imabio, France BioImaging)
Appliquer les principes et règles d'hygiène et de sécurité, et d’éthique scientifique

Compétences

Connaissances générales en biologie,
Connaissances théoriques et pratiques en imagerie photonique .
Connaissance pratique des logiciels de visualisation et traitements d’images et des plateformes intégrant des applications de deeplearning (Imaris, FIJI, Qupath, Cellpose …),
Connaissance de l’architecture des systèmes d’imagerie pour mieux connaitre leurs limitations expérimentales
Connaissance de la biophysique des sondes fluorescentes,
Connaissance en programmation Python et de suivi de projet/versioning seraient un plus
Langue anglaise : B1 à B2 (cadre européen commun de référence pour les langues).

Contexte de travail

L'IBDM situé sur le Campus de Luminy, comprend environ 220 personnes titulaires Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Ingénieurs et Techniciens et non permanents CDD, Post doc, Doctorants, stagiaires répartis sur 22 équipes de recherches et 11 plateaux techniques et services.
L'IBDM est une unité mixte de recherche sous une tutelle du CNRS et de l'AMU, qui explore le domaine de la Biologie du développement et des pathologies qui y sont associées.
L'activité s'exercera au sein de l’équipe de Cédric MATTHEWS
Le laboratoire étant composé de plusieurs nationalités, la pratique de la langue anglaise est indispensable

Contraintes et risques

Aucun