Missions

Le candidat (H/F) sélectionné aura un rôle clé dans le support technique à la mise en œuvre de projets de recherche axés sur l'étude de la biodiversité des organismes marins à l'aide de techniques avancées telles que le metabarcoding de l'ADN environnemental, la qPCR, la PCR digitale et le séquençage avec la technologie MinION (Nanopore).

Activités

Conduire des expériences courantes en biologie (biologie moléculaires, biochimie) :
- Gestion des échantillons : Réception, stockage adapté des prélèvements biologiques
- Extraction des acides nucléiques (ADN/ARN) et protéines
- Dosage par spectrofluorimétrie des acides nucléiques et protéines
- Visualisation sur gels des acides nucléiques
- Dosage biochimiques (Elisa, activités enzymatiques)
- Mettre en œuvre des techniques de PCR, qPCR et dPCR
- Mettre en œuvre du séquençage en utilisant le système minION développé par Nanopore®
- Rassembler et mettre en forme les résultats des expériences
- Rédiger et actualiser les protocoles techniques
- Tenir un cahier de laboratoire
Maintenir un environnement de laboratoire organisé et conforme aux bonnes pratiques de laboratoire (BPL).
Participer à la logistique du plateau technique : maintenance des équipements, gestion des réactifs et consommables, gestion des stocks.
Participer à la formation technique des utilisateurs et des stagiaires

Compétences

- Connaissances solides en techniques de biologie moléculaire (extraction, amplification et analyse de l'ADN) et biochimie (dosages et activités enzymatiques)
- Expérience pratique dans les techniques de metabarcoding, qPCR, dPCR et/ou séquençage MinION Nanopore®
- Rigueur en particulier pour la manipulation d'échantillons et de réactifs sensibles
- Savoir rendre compte
- Aptitude à travailler en équipe et à communiquer efficacement
- Curiosité intellectuelle
- Sens de l'organisation et gestion du temps

Contexte de travail

MARBEC est une UMR (IRD, Ifremer, Université de Montpellier, CNRS et INRAE) dont l'activité de recherche se situe dans le domaine de la biodiversité marine et ses usages. Elle compte 314 agents, est implantée en Occitanie (Sète, Montpellier et Palavas-les-Flots) et présente dans de nombreux pays étrangers.
Les activités scientifiques se déploient autour de 6 ambitions de recherche et sont soutenues techniquement par 4 dispositifs de recherche. Le plateau « biologie moléculaire » dépend du Dispositif d'Analyses en Laboratoire (DAL) regroupant les compétences techniques et les équipements nécessaires aux observations, mesures et expérimentations.

La personne recrutée sera sous la responsabilité du responsable scientifique du plateau de biologie moléculaire. L'accompagnement durant la prise de fonction sera assuré par les responsables du plateau.

Un nombre significatif de projets de l'UMR fait appel à la biologie moléculaire pour définir les abondances, la diversité, les fonctions des organismes marins. Situé sur les sites de Montpellier et Sète, le plateau de biologie moléculaire offre un parc instrumental (Thermocycleurs, robots d'extraction...) et des espaces dédiés aux analyses moléculaires pour l'ARN et l'ADN.

Des déplacements intersites seront possibles (3 à 4 par mois), leur fréquence varie selon les besoins de manipulations et de réunions de l'unité (Tam-Tam, assemblées¿).

Pour les transports inter-sites, l'unité met à disposition des véhicules administratifs et des déplacements par train TER sont possibles depuis Montpellier et Sète.
L'agent recruté pourra disposer sur demande d'un remboursement de titres de transports ou du forfait mobilité durable.

L'agent sera sensibilisé par les agents de préventions aux risques professionnels et risques pouvant subvenir lors de manipulations terrains. Le parcours de formation NEO CNRS devra être suivi et le respect du port des EPI sera nécessaire.