Missions

Choisir, développer et mettre en œuvre les approches de microbiologie et biologie moléculaire dans le
cadre de projets scientifiques des équipes étudiant les souches microbiennes marines (principalement
bactéries) associées aux macroalgues.

Activités

- Choisir, développer et adapter les protocoles d'étude des microorganismes associés aux
macroalgues, principalement bactéries :
* isoler et caractériser phénotypiquement les souches (suivis de croissance par turbidimétrie et
cytométrie, profils métaboliques, tests d'antibiorésistance)
* conduire les protocoles de mutagenèse sur souche non-modèle
* extraire, quantifier et séquencer les acides nucléiques (ADN et ARN) à partir des communautés
microbiennes et des souches isolées
* visualiser les microorganismes par des techniques de microscopie (FISH et CARD-FISH)
* cloner, optimiser l'expression hétérologue (chez E. coli ou autres bactéries) et purifier les
protéines d'intérêt
- Exploiter et présenter les résultats des analyses, en garantir le suivi et la qualité
- Rédiger des protocoles détaillés et des rapports d'expériences
- Former les nouveaux personnels aux techniques de microbiologie et de biologie moléculaire
développées
- Gérer et organiser la collection de souches microbiennes de l'unité

Compétences

Savoirs :
- Microbiologie (connaissance approfondie). Une expérience en microbiologie marine serait un plus
- Biologie moléculaire (connaissance approfondie)
- Langue anglaise : niveau A2 à B1 (cadre européen commun de référence pour les langues)

Savoir-faire :
- Maîtrise des techniques de suivi de culture de microorganismes en milieu liquide et solide
- Maîtrise des techniques de biologie moléculaire (extraction ADN/ARN, PCR et qPCR, clonage)
- Connaissances en génomique microbienne
- Connaissances en techniques de mutagenèse dirigée sur bactéries
- Connaissances en expression hétérologue de protéines

Savoir-être :
- Rigueur / fiabilité
- Sens de l'organisation
- Capacité à travailler en équipe
- Sens de la convivialité

Contexte de travail

L'ingénieur-e d'études en techniques biologiques exercera ses fonctions au sein du Centre
de Mutualisation et d'Appui à la Recherche (CMAR) de l'unité LBI2M à la Station Biologique de Roscoff,
sous la responsabilité hiérarchique du Directeur d'Unité.
Il/elle travaillera principalement avec les équipes Bioconversion Bactérienne des Macroalgues (BABIM) et Biologie des Algues et Interactions avec l'Environnement (ABIE), qui seront créées au 1er janvier 2025, date du nouveau contrat de l'unité.
Le LBI2M est une unité mixte de recherche sous la double tutelle du CNRS et de Sorbonne Université,
située en front de mer sur la côte du Finistère. Il compte environ 80 membres auxquels s'ajoutent de
nombreux visiteurs français ou étrangers séjournant au laboratoire. La recherche menée dans l'unité
LBI2M intègre des approches interdisciplinaires et multi-échelle (du gène à la communauté) pour mieux
comprendre les interactions des organismes entre eux et avec leur environnement. En particulier,
l'étude des microorganismes associés aux macroalgues est un point fort de l'unité, avec le concept
émergent d'holobionte. L'étude génétique et phénotypique de bactéries marines modèles s'est également
développée, pour pouvoir comprendre leurs fonctions biologiques au sein de communautés complexes.