Missions

Le poste se situe sur la plateforme de microscopie photonique du CIML. Sous l'autorité du responsable technique de la plateforme, la mission principale de l'ingénieur(e) sera de mettre à disposition des utilisateurs des équipements et des savoir-faire dans le domaine de la microscopie optique appliquée à la biologie.

De manière plus spécifique, l'ingénieur(e) se verra confier une mission conventionnelle de service consistant à la formation, au suivi des performances des instruments et au suivi des projets d'imagerie et une mission de R&D en analyse d'images.

Activities

- Former aux principes et à la mise en œuvre des techniques d'acquisition et d'analyse des données biologiques (formations internes, externes, enseignement, etc.),
- Organiser, gérer et coordonner les interventions de maintenance et de dépannage des services et prestataires concernées en interne et en externe (métrologie et panne des microscopes),
- Orienter et conseiller les utilisateurs pour la mise en œuvre des méthodes d'étude et d'interprétation des résultats (acquisition, analyse d'images et interprétation des résultats),
- Analyser les données issues de travaux de recherche propres et collaboratifs,
- Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques sous forme de rapports, brevets, publications, présentations orales,
- Assurer et organiser la veille scientifique et technologique couvrant les différents aspects de la microscopie photonique,
- Participer à l'animation des réseaux professionnels d'échange de savoirs et de savoir-faire,
- Consolider la démarche qualité mise en place sur la plateforme.

Skills

- Maîtrise des techniques de microscopie optique de base et avancées appliquées à l'exploration du vivant notamment la microscopie confocale, la vidéo-microscopie, la microscopie de super résolution et la spectroscopie à corrélation de fluorescence
- Recueil, analyse et traitement des données (connaissance approfondie),
- Capacité à utiliser un langage de programmation pour automatiser le traitement d'images et l'analyse des données
- Capacité à utiliser les logiciels appliqués en analyse d'images (ImageJ, QuPath, etc.),
- Compétence en machine Learning (création d'un modèle à partir d'une architecture connue ex U-Net)
- Savoir concevoir des outils pédagogiques adaptés,
- Connaissance de base en biologie (biologie cellulaire, histologie, etc.),
- Connaissance de l'environnement et des réseaux professionnels,
- Langue anglaise : B2 à C1 (cadre européen commun de référence pour les langues),
- Savoir s'adapter aux avancées technologiques du domaine,
- Savoir former et accompagner les utilisateurs du service,
- Savoir diffuser et valoriser les résultats (rapports, brevets, publications, présentations),
- Savoir dialoguer avec les prestataires de service,
- Savoir anticiper les besoins et mener une veille technologique.

Work Context

Unité mixte de recherche du CNRS, de l'Inserm et d'Aix-Marseille Université, le Centre d'Immunologie de Marseille-Luminy (CIML) est composé d'environ 200 personnes et 16 équipes de recherche, 5 plateformes technologiques, deux animaleries et 8 services supports. Le CIML est situé sur le parc scientifique et technologique de Luminy à Marseille (France). C'est un institut de recherche internationalement reconnu dans le domaine de l'immunologie et qui intervient dans tous les champs contemporains de cette discipline.
http://www.ciml.univ-mrs.fr/

Sous l'autorité du responsable technique et du responsable scientifique, l'ingénieur(e) occupera un poste d'ingénieur.e d'études de plateforme de microscopie photonique.
La plateforme comprend une quinzaine de systèmes de microscopie de base et avancés utilisés par plus de 70 utilisateurs par an, qui ont besoin d'être formés et soutenus dans leurs projets scientifiques, tant au niveau de l'acquisition d'images expérimentales que de l'analyse des données.