Missions

La personne recrutée devra développer et conduire les approches méthodologiques à haut-débit du
service de production de protéines recombinantes et d'interaction protéine-protéine de la plateforme
de biologie structurale intégrative de Marseille (PBSIM).

Activités

- Assurer la production et la purification des protéines pour les utilisateurs et les collaborateurs
de la plateforme.
- Contribuer à choisir et à établir/adapter les protocoles (notamment ceux à haut-débit) pour la
production, la purification et les études d'interaction protéines-protéines des protéines
recombinantes d'intérêt
- Mettre en œuvre, optimiser, valider et rédiger ces protocoles ; identifier les problèmes potentiels.
- Conseiller les utilisateurs internes et externes du service ; contrôler le bon usage des équipements
- Participer à la formation des utilisateurs
- Consigner, rédiger les rapports expérimentaux et présenter les résultats à l'oral et à l'écrit
- Assurer et faire respecter l'entretien et la maintenance de premier niveau des équipements (robots
pipetages...), des espaces et du matériel
- Contribuer à la gestion des stocks et aux commandes de matériels consommables

Compétences

Savoirs :
- Connaissances théoriques et pratiques de biochimie.
- Communication orale et écrite en français et en anglais (niveau B2 à C1)

Savoir-faire :
- Expression et production de protéines dans la bactérie Escherichia coli, notamment à haut-débit
- Biochimie des protéines : purification par chromatographie liquide (IMAC, affinité, échange
d'ions, gel filtration, etc) sur automate (robot Tecan Evo 200) ou sur appareil automatisés de type
AKTA, HPLC/UPLC Waters
- Caractérisation des protéines (spectrométrie UV, SDS-PAGE, microfluidique type LabChip GX);
manipulation des protéines (concentration, stockage de court ou long terme) ; contrôle qualité

Savoir-être :
- Rigueur expérimentale, sens de l'organisation
- Capacité d'adaptation et autonomie
- Aptitudes relationnelles, capacité à travailler en équipe et à encadrer les étudiants,
utilisateurs et collaborateurs sur la plateforme

Contexte de travail

L'AFMB est un centre CNRS-AMU localisé sur le campus de Luminy à Marseille. Les recherches visent à décrire, à l'échelle de l'atome, l'architecture 3D de protéines pour comprendre les mécanismes biologiques qui leur sont associés. Elle est composée d'environ 80 personnes repartit en 5 équipes de recherche, plusieurs plateformes et un service de support.
La plateforme de biologie structurale intégrative de Marseille (PBSIM) est labellisée IBiSA et Aix-Marseille, et fait partie de l'infrastructure nationale de biologie structurale intégrative (FRISBI). PBSIM rassemble 6 services complémentaires dotés d'équipements de pointe et accessibles à une large communauté scientifique académique et industrielle.
L'ingénieur d'étude (H/F) intégrera le service de « production dans E. coli, purification et interaction de protéines à haut-débit ». Il ou elle sera sous la responsabilité de l'ingénieur de recherche statutaire qui la dirige. L'équipe est actuellement composée de 5 personnes non statutaires. Ce service existe depuis 2004 et réalise de façon semi-automatique, en utilisant ses propres méthodes à haut-débit, publiées, l'ensemble des étapes depuis le clonage des gènes jusqu'aux protéines purifiées ainsi que la caractérisation de leurs affinités d'interaction. L'équipe est reconnue internationalement et travaille avec des robots et appareils spécifiques qui ont tous été renouvelés entre 2023-2025. L'ingénieure d'étude (H/F) sera formé, si nécessaire, sur ces équipements spécifiques. Depuis son lancement, plus de 10 000 protéines ont été produites pour ses clients, ses collaborateurs ou ses partenaires dans des réseaux nationaux (16 ANR) ou internationaux (douze réseaux européens). Cette activité va encore augmenter pour la production et la purification de milliers de protéines prédites par les approches d'intelligence artificielle.
La plateforme enseigne régulièrement dans des formations locales (Polytech, Plinius), nationales (FRISBI, INSERM) et internationales (EMBO).