Missions

L'ingénieur aura pour rôle principal d'apporter une expertise dans l'utilisation des méthodes
mathématiques, algorithmiques, et/ou d'apprentissage automatique pour résoudre des problèmes
théoriques et appliquées en bioinformatique. Il contribuera également à l'analyse des données
biologiques et participera à la conception, au développement, et à l'implémentation des moyens
informatiques associés.

Activités

1 Formalisation des problématiques scientifiques :

Collaborer avec les chercheurs pour formaliser les questions scientifiques, modéliser les problèmes,
et définir des approches adaptées pour leur résolution.

2 Développement de méthodes d'analyse :

Concevoir, développer ou adapter des méthodes statistiques et de modélisation, en intégrant des
outils d'apprentissage automatique ou des techniques avancées selon les besoins.

3 Sélection des outils et infrastructures :

Identifier et déployer les moyens logiciels et matériels les plus performants et pertinents pour
répondre aux objectifs du projet, tout en optimisant les ressources. La maitrise des outils de
développement web serait un atout.

4 Organisation et gestion des données :

Structurer, organiser et suivre le traitement des données, en mettant en place des workflows
reproductibles et en assurant leur exploitation jusqu'à leur visualisation.

5 Valorisation des résultats :

Produire des visualisations claires, rédiger des rapports et publications, et contribuer à la
présentation et à la diffusion des résultats auprès de la communauté scientifique.

Compétences

Connaissances transversales requises :

- avoir une connaissance avancée en bioinformatique, en statistiques et data science
- avoir une connaissance avancée de langages tels que R, Python, shells Unix
- avoir un bon niveau de programmation et un goût pour le développement d'algorithmes.

Connaissances souhaitables :

- avoir un bon niveau en développement logiciel

Savoir-faire :

- maîtriser l'anglais : rédaction de documents techniques en anglais et relations avec les
collaborations
internationales.

Savoir-être :

- Avoir le sens des responsabilités
- savoir travailler conjointement avec l'équipe de recherche
- avoir un bon relationnel, le sens de l'organisation, le goût du travail en équipe
- avoir l'esprit d'initiative
- travailler avec rigueur
- être adaptable, disponible, avoir le sens du service

Contexte de travail

Le LCQB a été créé en 2009 comme un environnement interdisciplinaire dédié à l'étude de l'évolution
et de la génomique. Le LCQB regroupe aujourd'hui plusieurs équipes composées de mathématiciens, de
physiciens et d'informaticiens spécialisés dans la modélisation de systèmes biologiques complexes,
ainsi que d'expérimentateurs experts en génomique fonctionnelle, en génétique et dans le domaine
émergent de la biologie synthétique. En 2014, le LCQB a élargi son champ d'action en intégrant
l'institut de Biologie Paris-Seine (IBPS), favorisant ainsi les collaborations en biologie
fondamentale avec d'autres disciplines, notamment les neurosciences, le développement et le
vieillissement.
En 2023, le LCQB a pris l'initiative de créer la première biofonderie en France, qui accueille
aujourd'hui nos équipes de biologie synthétique et représente un pôle d'innovation et de
collaboration dans les sciences biologiques. Actuellement, le LCQB occupe une position de premier
plan en France, reconnu pour la qualité de ses recherches et sa vision. Le LCQB est l'une des unités
de Sorbonne Université, université pluridisciplinaire et de recherche intensive située au cœur de
Paris.
La personne recrutée sera rattachée directement à la directrice de l'unité.


Cette fonction ouvre droit à la perception d'une prime informatique,
l'IRI (Indemnité de Référence pour les Informaticiens)