Missions

L'ngénieur-e en techniques biologiques gérera le fonctionnement quotidien des équipes FIONA
(Functional Imaging of Nuclear Architecture) dirigée par Judith Miné-Hattab et HEAL (Horizontal
Evolution of Eukaryotic ALgae) dirigée par Richard Dorrell, avec une répartition du temps 60/ 40
entre les deux groupes.
Ces deux équipes, bien que travaillant sur des systèmes différents, sont réunies par l'utilisation
des approches de la biologie moléculaire et de la microscopie pour comprendre la biologie
fondamentale de la diversité des micro-organismes eucaryotiques.

Le/ la candidat.e sera notablement améné.e à créer des plateformes et outils (inventaires de
stocks...) communs entre les deux équipes, et organisera des réunions hebdomadaires pour renforcer
les
liens techniques et conceptuels entre les deux groupes.

Activités

- Assurer la formation des nouveaux arrivants aux règles et techniques de laboratoire.
- Gérer les bases de données d'échantillons biologiques (souches de micro-organismes, de
plasmides, d'amorces ADN, de bactéries E.coli, de levures et lignée de cellules humaines).
- Gérer les stocks et les commandes de réactifs (milieux de culture, réactifs chimiques).
- Superviser l'application des règles d'hygiène et de sécurité.
- Assurer l'entretien et la maintenance de premier niveau du matériel.
- Organiser et gérer les relations avec les fournisseurs

Le/ la candidat.e pourra être aidé.e par des ITA embauchés en CDD par les deux équipes.

De plus, le/ la candidat.e sera chargé.e du développement de projets transversaux entre les deux
groupes. Un premier projet sera l'expression d'une protéine nouvelle d'algues marines, impliquée
dans le transport des métabolites chloroplastiques, en levure.

Des futurs projets entre les deux équipes pourraient inclure entre autres :

- Mise au point de protocoles pour la microscopie super résolution sur différents organismes
utilisés par l'équipe Dorrell.
- Caractérisation de lignées humaines génétiquement modifiée.
- Mise au point de protocoles pour cultiver des sphéroïdes de cellules humaines.

Compétences

- Biologie moléculaire : PCR, clonage de plasmides, construction de souches de levure, cripser-Cas9,
séquençage, extraction d'ARN et ADN.
- Western Blot, caractérisation de lignée de cellules.
- Microbiologie : mise en culture stérile des organismes eucaryotes. Une connaissance préalable de
la culture d'algues et de la culture en L2 serait préférée mais pas essentielle.
- Informatique : utilisation de Windows office. Une expérience préalable dans l'utilisation d'outils
de gestion du laboratoire (Geslab...) serait appréciable.
- Administration d'un groupe de recherche : expérience dans la gestion des stocks, obtention des
devis, négociation et suivi des contrats de maintenance.
- Niveau d'anglais suffisant pour travailler avec des collègues ou utilisateurs non francophones
(Niveau B1 cadre européen commun de référence pour les langues)

Contexte de travail

Le LCQB est une unité mixte de recherche pluridisciplinaire composée à la fois d'équipes théoriques
(bio-informatique, mathématiques et physique) et expérimentales (microbiologie, génétique,
génomique, etc.).
L'équipe FIONA étudie les changements d'organisation et de dynamique nucléaire en réponse au stress
tel que la compression cellulaire ou les dommages de l'ADN. L'équipe utilise et développe des
approches de microscopie de super-résolution, combinées à des outils de micro-fluidique et de
modélisation. Grace à l'implémentation de différents modules de microscopie, l'équipe met en place
des techniques de microscopie de pointe unique sur le plan international. Ces techniques, ainsi que
les méthodes d'analyse correspondantes, sont mises à la disposition de la plateforme CIF de l'IBPS.
L'équipe HEAL étudie l'histoire évolutive et biologie cellulaire et environnementale d'algues
marins, avec une forte emphase sur des lignées originaires des endosymbioses secondaires et des
écosystèmes fragilisés par l'activité anthropogénique (l'Océan Arctique). L'équipe maîtrise en
particulier l'utilisation des techniques informatiques pour comprendre les innovations évolutives
qui expliquent la biologie des algues modernes, et l'application de la biologie moléculaire aux
algues transformables pour préciser les phénotypes des protéines nouvelles et méconnues dans ces
groupes. Les futurs projets de l'équipe viseront intégrer l'algue verte Chlamydomonas, déjà utilisé
au LCQB, dans ces projets, ainsi que de développer des nouveaux modèles expérimentaux pour des
groupes d'algues importants dans l'écosystème marin, avec un fort intérêt dans les impacts du
réchauffement global de l'océan sur sa présente et future biodiversité.
Ces deux équipes souhaitent également développer des projets transversaux qui réuniront ces deux
axes de recherche pour comprendre la diversité et le fonctionnement cellulaire des micro-organismes
eucaryotiques.