Missions

Au sein du laboratoire "Molecular Microbiology and Structural Biochemistry" (MMSB), l'ingénieur-e d'études devra concevoir, optimiser, performer et développer de nouvelles méthodologies dans le cadre de thématiques de recherche en microbiologie de l'équipe «Ecologie Moléculaire et Evolution des Phages».

Activités

- Conduire, en adaptant les conditions expérimentales, un ensemble de techniques de biologie moléculaire (clonage, purification d'ADN, Séquençage, etc.) et microbiologie (cultures, production de phages, test phénotypiques, etc.)

- Exploiter et présenter les résultats des analyses, en garantir le suivi et la qualité

- Rédiger et actualiser des protocoles, et des notes techniques

- Consigner ses expériences dans un cahier de laboratoire, établir des comptes rendus d'activité et des rapports d'expériences

- Présenter les résultats pendant les réunions d'équipe

- Accompagner les étudiants dans leur apprentissage des bases de microbiologie et biologie moléculaire.

- Assurer un suivi des appareils de laboratoire

- Gérer les stocks et les commandes de matériels courants et consommables

- Gérer les milieux microbiologiques, la verrerie de laboratoire et veiller à l'élimination des déchets biologiques

- Veiller à la mise en application des règles d'hygiène et de sécurité au laboratoire

Compétences

- Connaissance en biologie moléculaire et génétique bactérienne (clonage, purification d'ADN, construction de mutants, qPCR, sélection CRISPR-Cas13 etc.)

- Connaissance en microbiologie cellulaire/écologie et évolution microbienne (cultures, suivi de croissance, expérience de compétition, évolution expérimentale, caractérisation phénotypique)

- Connaissance en biologie des phages (isolement à partir d'échantillon environnementaux, production, purification, quantification, one-step growth curve, manipulation génétique des phages, phage training)

- Utilisation d'outils bioinformatiques (analyse données NGS, alignements, genome mining)

- Analyses statistiques

- Travail en laboratoire BLS2

- Connaissances et manipulation de Pseudomonas aeruginosa et Escherichia coli

- Capacité de lecture, de compréhension et de mise en place de méthodes issues de publications scientifiques

- Rigueur, autonomie, dynamisme, bonne capacité à travailler en équipe.

- Anglais (niveau B2)

Contexte de travail

Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que l'arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.

La personne recrutée rejoindra l'unité Microbiologie Moléculaire et Biologie Structurale (UMR 5086 CNRS, Université de Lyon). Cette Unité est située sur le Campus Biosciences de Lyon-Gerland et rassemble 10 équipes de recherche, pour un total d¿environ 90 agents. Elle travaillera au sein d'une équipe ATIP-Avenir nouvellement créée en étroite collaboration avec un.e postdoctorant.e et une doctorante.