Missions

Le candidat ou la candidate aura pour mission de contribuer aux activités de recherche, développement
et service au sein de projets en virologie et en immunologie. Il ou elle utilisera des modèles in
vitro et in vivo innovants susceptibles d'être infectés par divers virus et bactéries respiratoires et
autres agents (bétacoronavirus, SARS-CoV-2, RSV, influenza, Rhinovirus, MPV, HIV, Zika, Dengue,
Chikungunya, HSV) afin d'étudier les interactions hôte-pathogène, d'évaluer l'efficacité de stratégies
thérapeutiques et d'analyser leurs mécanismes d'action.

Activités

1. Développer et optimiser des modèles d'infection in vitro et in vivo en environnement BSL2/3,
incluant la production virale, les titrations (PFU, TCID50, qRT-PCR) et la mise en place de tests de
criblage pour l'évaluation de l'efficacité et du mécanisme d'action de molécules thérapeutiques.
2. Réaliser des expérimentations animales (rongeurs) : injections (IP, IV, SC), prélèvements
d¿organes, suivi des cohortes de souris génétiquement modifiées, en conformité avec la
réglementation éthique.
3. Mettre en place et conduire des protocoles d'analyses virologiques et immunologiques, incluant
cultures cellulaires, ELISA, ELISpot, pléthysmographie, tests fonctionnels in vitro et in vivo de
populations immunitaires et épithéliales
4. Participer dans le développement des approches innovantes, telles que la nébulisation,
microscopie bioluminescente et fluorescente pour le suivi in vivo des infections, ainsi que la
plateforme de comportement dans les conditions infectieux et des modèles d'organoïdes de poumon et
de cerveau à partir des hES et iPSC en coculture avec les cellules immunes et stromales.
5. Préparer et analyser des échantillons biologiques : suspensions cellulaires, marquages en
cytométrie en flux, acquisitions et analyses de données, préparation pour l'histologie, ainsi que
des acquisitions et analyses d'imagerie pour l'interprétation des résultats expérimentaux.
6. Assurer les activités de recherche, développement et innovation, incluant la revue de
littérature, l'optimisation des protocoles techniques et la mise en place de nouvelles procédures
expérimentales.
7. Rédiger la documentation scientifique et technique, analyser les résultats, rédiger les comptes
rendus et présenter les données en réunion d'équipe.
8. Participer au fonctionnement du laboratoire : gestion des stocks, tâches communes, respect des
règles de sécurité, et contribution à la formation des étudiants et stagiaires.

Compétences

Savoirs :
- Connaissances solides en virologie, immunologie et microbiologie
- Maîtrise des principes de culture cellulaire, biologie moléculaire (ARN, PCR, qRT-PCR) et
techniques d'analyse immunologique
- Compréhension des règles éthiques et réglementaires liées à l'expérimentation animale

Savoir-faire :
- Réaliser des expérimentations animales (souris) : manipulations, injections, prélèvements, en
conformité avec les règles éthiques
- Effectuer des cultures cellulaires, ELISA, Western blot et préparer des échantillons pour
l'histologie
- Mettre en œuvre des techniques de virologie : culture virale, titrations (PFU, TCID50), tests de
séroneutralisation
- Préparer des suspensions cellulaires, réaliser les marquages en cytométrie en flux, acquérir et
analyser les données
- Effectuer les analyses moléculaires : extraction d'ARN, PCR, qRT-PCR
- Analyser, interpréter et synthétiser les résultats expérimentaux
- Rédiger des comptes rendus clairs et présenter efficacement les données en réunion

Savoir-être :
- Rigueur, sens de l'organisation et respect strict des règles de sécurité biologique
- Capacité à travailler de manière autonome tout en collaborant efficacement au sein d'une équipe
pluridisciplinaire
- Adaptabilité, réactivité et sens des responsabilités
- Bonnes capacités de communication écrite et orale

Contexte de travail

Le poste est rattaché au CIPHE (Centre d'Immunophénomique), une unité d'appui et de recherche
spécialisée dans le développement de modèles précliniques innovants, l'étude du système immunitaire
et l'analyse fonctionnelle de gènes et voies immunitaires dans les conditions normales et
pathologiques (inflammation, auto-immunité, cancer, infectieux). L'unité rassemble des équipes
pluridisciplinaires et met à disposition des plateformes technologiques de pointe pour l'étude des
interactions hôte-pathogène.
La personne recrutée exercera ses activités au sein d'environnements soumis à des exigences de
sécurité renforcées, notamment le travail en milieu confiné de type A3/L3, ou en zones protégées,
impliquant une surveillance médicale obligatoire assurée par l'employeur.
Le poste comporte des activités de manipulation et d'expérimentation sur modèles murins et
organoïdes, incluant le suivi de cohortes et la réalisation de procédures expérimentales
réglementées. Il implique également le travail avec des agents infectieux de classes A2 à A3, tels
que des virus et bactéries respiratoires (bétacoronavirus : SARS-CoV, MERS-CoV, SARS-CoV-2),
Influenza, RSV, ainsi que d'autres agents comme le HIV.
L'organisation du travail peut nécessiter, selon les projets en cours, une charge ponctuellement
importante, ainsi que des horaires décalés pour répondre aux contraintes expérimentales. Le poste
requiert également la participation à des astreintes le week-end, selon un planning défini au sein
de l'équipe.
La personne recrutée travaillera au sein d'une équipe de cinq personnes et sera chargée de mener de
manière autonome les expérimentations, activités de développement et missions de service qui lui
seront confiées. Elle exercera ses fonctions sous la supervision d'un ingénieur de recherche.