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Ingénieur-e biologiste en analyse de données H/F


Date Limite Candidature : jeudi 16 janvier 2025 17:00:00 heure de Paris

Informations générales

Réservé uniquement aux agents CNRS (fonctionnaires et CDI)
Intitulé de l'offre : Ingénieur-e biologiste en analyse de données H/F
Référence : UAR2040-MOBINT-J55015
Lieu de travail : MONTPELLIER
Institut : INEE - Institut d'écologie et environnement
Date de publication : mardi 3 décembre 2024
Session : Campagne Hiver 2025
Groupe de Fonction : IRG3
BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en analyse de données

Missions

Concevoir, organiser et valoriser des développements et déploiements instrumentaux en biologging (mesures physiologiques, cérébrales, comportementales et environnementales) ainsi que des méthodes avancées de traitement des données associées (traitement du signal et machine learning), appliqués à l'écophysiologie animale et à l'écologie du mouvement.

Activités

Développer et optimiser des dispositifs de biologging
- Concevoir des capteurs et loggers adaptés aux études physiologiques, comportementales et environnementales des espèces animales ciblées.
- Adapter des dispositifs pour des conditions variées (terrestres, marines, etc.) et les optimiser pour minimiser leur impact sur les animaux étudiés.

Gérer des projets de recherche multidisciplinaires
- Collaborer avec des chercheurs (H/F) en écologie, physiologie et sciences des données pour définir des objectifs et besoins instrumentaux spécifiques.
- Planifier les étapes du projet, suivre les échéances, coordonner les équipes de terrain et personnes impliquées dans le projet.

Analyser les données et développer des méthodes de traitement
- Développer des pipelines de traitement de signal et de machine learning pour l'analyse des données de biologging.
- Extraire et interpréter des paramètres physiologiques (e.g., rythme cardiaque, température), comportementaux (e.g., activité, sommeil), et environnementaux (e.g., température ambiante, pression).

Valider et étalonner des outils
- Mettre en place des protocoles de validation assurant la précision et la fiabilité des données collectées.
- Réaliser des tests en laboratoire et sur le terrain pour vérifier l'efficacité des instruments.

Former et accompagner les personnes utilisatrices
- Former aux méthodes de déploiement des dispositifs de biologging et d'analyse des données.
- Créer des guides d'utilisation et d'assistance technique.

Assurer une veille technologique et une amélioration continue
- Suivre des innovations pour intégrer les technologies émergentes dans les projets.
- Réévaluer régulièrement les méthodes et dispositifs pour optimiser les performances et réduire les coûts.

Valoriser et diffuser les résultats
- Rédiger des rapports, articles scientifiques, et demandes de financement.
- Présenter les travaux lors de conférences et de séminaires scientifiques nationaux et internationaux.

Compétences

Connaissances scientifiques et techniques
- Biologging et instrumentation : expertise dans les technologies de capteurs pour les mesures physiologiques, comportementales et environnementales, avec maîtrise des techniques de déploiement et d'étalonnage en laboratoire et sur le terrain.
- Écophysiologie et écologie du mouvement : connaissances approfondies en physiologie comparative et écologie comportementale.
- Traitement du signal et apprentissage automatique : compétences en traitement de signal et en apprentissage automatique pour l'analyse et la modélisation de données biologiques et comportementales.
- Programmation et analyse de données : maîtrise de MATLAB, Python, R, et des bibliothèques spécialisées pour traiter et analyser des données spatio-temporelles.

Compétences relationnelles et organisationnelles
- Gestion de Projet : capacité à organiser, planifier et coordonner des projets scientifiques, avec suivi rigoureux des échéances et gestion des ressources.
- Communication et Vulgarisation : aptitude à présenter des concepts techniques de manière claire pour des publics variés, et à rédiger des rapports et publications scientifiques dans un contexte international (Anglais C1).
- Travail d'équipe : efficacité à collaborer dans des équipes pluridisciplinaires, en assurant la fluidité des échanges et l'intégration des idées.
- Adaptabilité et Résolution de Problèmes : capacité à s'ajuster face aux imprévus techniques et logistiques, et faire preuve de créativité pour proposer des solutions face aux défis de terrain.
- Autonomie et Initiative : aptitude à travailler de manière autonome, en anticipant les besoins et en proposant des améliorations continues.

Contexte de travail

L'UAR Montpellier Ecologie Evolution Biodiversité (MEEB) a pour vocation de gérer les outils, équipements et compétences mutualisées pour les scientifiques et les unités de la communauté. Cette unité, sans murs, gère actuellement deux plateformes, GenSeq située sur le campus universitaire Triolet et PACE située sur le campus CNRS Route de Mende via les deux UMR hébergeantes que sont l'ISEM et le CEFE. L'UAR travaille en étroite collaboration avec ces deux UMR.
La personne recrutée sera hébergée au CEFE où elle sera en contact direct avec les chercheurs et plateformes nécessitants son appui. Il/Elle sera placé sous la responsabilité hiérarchique de la directrice de l'UAR MEEB et sous la responsabilité fonctionnelle de la directrice du CEFE.