Description du sujet de thèse

Les lipides constituent une classe hétérogène de biomolécules impliquées dans le stockage d'énergie, la signalisation, et la modulation des fonctions des protéines membranaires. Les lipides sont des métabolites complexes qui présentent une importante diversité structurale et fonctionnelle, dues notamment à la coexistence de multiples isomères. La structure moléculaire et les fonctions biologiques des lipides sont étroitement liées, ce qui rend cruciale une annotation précise de ces composés. La caractérisation structurale au niveau isomérique des lipides complexes offre donc une opportunité d'améliorer la compréhension de la relation entre le métabolisme des lipides et leurs activités biologiques. Depuis qu'il a été démontré que les lipides complexes tels que les glycérophospholipides (GPL) portant une position particulière de double liaison, pouvaient être des biomarqueurs de diverses maladies, le développement d'une méthode analytique au niveau isomérique constituerait une avancée significative pour le diagnostic précoce de nombreuses pathologies.
Dans ce contexte, le projet de thèse vise à développer une méthode MS sensible et robuste basée sur l'adduction par le cuivre pour caractériser les lipides complexes à tous les niveaux isomériques. La spectrométrie de masse en tandem (MS/MS) sera utilisée pour mener à bien ce projet en couplage à différentes méthodes séparatives telles que la chromatographie et la spectrométrie de mobilité ionique (IMS). Au-delà des connaissances fondamentales sur la réactivité en phase gazeuse et la conformation des lipides adduits au cuivre, les résultats de ce projet auront de multiples conséquences en lipidomique.

Le candidat, qui rejoindra l’équipe de recherche au sein de l’Institut de Chimie des Substances Naturelles, doit avoir une solide formation en chimie analytique. Le candidat doit être capable de travailler de manière autonome, avec un sens d'adaptabilité et de créativité. Il/elle devra également aimer travailler en équipe, sur un projet collaboratif avec le laboratoire LAMBE, situé à l’Université Evry Paris Saclay.
Une lettre de motivation accompagnée d'un CV ainsi que les relevés de notes et classements de M1 et M2 seront demandés.

Contexte de travail

L'Institut de Chimie des Substances Naturelles est une Unité Propre de Recherche du CNRS dont les axes de recherche sont la chimie et la biologie. Il fait partie de l'Université Paris-Saclay qui regroupe, depuis 2015, les établissements de recherche et d'enseignement du sud parisien. L'ICSN est situé sur le campus de Gif-sur-Yvette et compte 125 agents dont 80 permanents répartis sur 3 bâtiments. Au sein du Département "Chimie et Biologie Structurales et Analytiques" l'agent recruté intègrera l'équipe de spectrométrie de masse constituée de 2 chercheurs et 2 ingénieurs. L’agent travaillera en lien direct avec le responsable d'équipe, ainsi qu'en collaboration avec les autres membres de l'équipe. Des déplacements sur le site du LAMBE (Evry-Courcouronnes) seront également à prévoir pour les expériences de mobilité ionique.

Contraintes et risques

Typiques d'un laboratoire d'analyse