Description du sujet de thèse

Les nouvelles technique de séquençage permettent de sonder le répertoire immunitaire des anticorps avec une profondeur inégalée. Cependant, l'organisation et la dynamique de ces répertoires est encore mal comprise à un niveau quantitatif. Cette thèse a pour but de construire et d'inférer à partir des données des modèles d'émergence et d'évolution des lignées d'anticorps constituant le répertoire. Les modèles combineront la génération de séquences aléatoires à l'origine des lignées, puis de mutations et de division simulant la maturation d'affinité. Les modèles résultant permettront de servir de base statistique pour détection la présence de perturbations dans les répertoire, notamment de réponses immunitaires spécifiques.

Contexte de travail

L'étudiant évoluera dans le groupe de T. Mora et A. Walczak travaillant à diverses questions de biophysique théorique, ainsi qu'aux groupes plus large de biophysique au LPENS, et à l'institut qbio de l'ENS.

Contraintes et risques

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