H/F Contrat doctoral

Description du Poste

Sujet De Thèse

Hyper accumulation du vanadium chez les holobiontes d’éponges : contribution bactérienne et rôle physiologique.

Votre Environnement de Travail

L’hyper accumulation de l’élément métallique vanadium (V) a été montrée récemment chez deux éponges homoscléromorphes. Les objectifs de la thèse visent 1) à déterminer si les communautés bactériennes sont concernées elles-mêmes par l’hyper accumulation et/ou impliquées dans le processus (voies métaboliques), 2) quel est le rôle physiologique de cette hyper-accumulation, 3) participer à l’étude des mécanismes moléculaires ? impliqués et 4) évaluer la possibilité d’utiliser ces holobiontes pour séquestrer du V à des fins de biorémédiation ou recyclage. Le projet de thèse s’inscrit dans un projet plus large financé par l’ANR qui implique quatre laboratoires ; l’étude mise en œuvre s’appuiera donc sur une approche intégrative.
MISSIONS
Le doctorant devra s’impliquer dans la préparation des échantillons biologiques et expérimentalement dans les différentes techniques mises en œuvre pour répondre aux objectifs précédents (bioinformatique, physiologie, chimie, biologie cellulaire : approche intégrative de la molécule à l’écosystème). Il devra assurer une veille bibliographique et présenter régulièrement à l’oral ses résultats devant le consortium. Il/elle devra rédiger en collaboration les articles issus de ses travaux, présenter ses résultats lors de congrès et rédiger son manuscrit de thèse.
ACTIVITÉS
- Séparer les bactéries des cellules d’éponges hyper accumulatrices par cytométrie en flux puis évaluer par ICPMS si les symbiotes accumulent également le vanadium
- Comparer par metabarcoding si les communautés bactériennes sont différentes entre espèces proches hyper accumulatrices et non hyper accumulatrices, le cas échéant déterminer d’éventuelles familles bactériennes susceptibles d’être impliquées dans ce mécanisme.
- Participer à la caractérisation de l’expression des gènes candidats ou à la localisation des protéines potentiellement dans le mécanisme d’hyperaccumulation
- Comparer les teneurs de V entre individus exposés ou non au V
- Comparer la tolérance au stress oxique des espèces accumulatrices et non accumulatrices
- Comparer les composés chimiques émis par les espèces accumulatrices et non accumulatrices
COMPÉTENCES
- Implication forte dans le projet
- Rigueur, honnêteté scientifique, persévérance
- Communication et rédactionnelle en français et en anglais
- Capacités d’adaptation
- Bases solides en biologie moléculaire, cellulaire, physiologie : expérience pratique nécessaire
- Bases de chimie environnementale, microbiologie et statistiques
- Bases en bioinformatique et métabarcoding
- Connaissance des porifères

Contraintes et risques

Déplacements à prévoir entre les laboratoires impliqués (LCB, IMBE, CEREGE, BIAM) : permis B recommandé.
Travail exceptionnel le week-end ou en soirée
Déplacements à l’étranger pour assister à des conférences internationales

Rémunération et avantages

Rémunération

2300€

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

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