Description du sujet de thèse

Un poste de doctorant est ouvert à l'Institut Fresnel à Marseille pour étudier les interactions biophysiques à l'origine de la morphogenèse dans des environnements 3D complexes.
Le ou la candidate étudiera les interactions entre différents types de cellules et de tissus au sein de la pupe de drosophile au début de la métamorphose, en se concentrant sur la manière dont ces interactions conduisent au remplacement des tissus larvaires par des tissus adultes.
La nature ambitieuse du projet réside dans son objectif d'étudier la morphogenèse dans un contexte intégré et multi-tissulaire, abordant différentes échelles -- des processus cytosquelettiques subcellulaires à l'organisme entier
Le candidat bénéficiera d'un accès exceptionnel à des technologies d'imagerie de pointe, dont un spinning disc personnalisé pour évaluer la dynamique cellulaire, la microscopie à fluorescence polarisée des réseaux d'actine, la super-résolution et la microscopie intelligente. Le projet est mené en étroite collaboration avec Philippe Roudot, également à l'Institut Fresnel, pour l'analyse d'image.

Nous sommes à la recherche d'un ou d'une étudiante en biologie cellulaire et du développement ou en biophysique.

Contexte de travail

Le poste est ouvert au sein de l'institut Fresnel à Marseille, dans l'équipe mosaic (Loïc Le Goff) et en collaboration avec l'équipe Phyti (Philippe Roudot). L'environnement combinant expertise en biologie, ingénierie optique et science des données, offre un cadre idéal pour une personne intéressée par la pluridisciplinarité.

Quelques publications récentes du laboratoire dans ce contexte:

Debadarshini, Legoff*, Mavrakis* (2025). Septins in animal tissue architecture: more than just peanuts. preprint. 10.13140/RG.2.2.17126.33607
-Mazzella, Mangeat, Giroussens, Rogez, Li, Creff, Saadaoui, Martins, Labouesse, Idier, Galland, Allain, Sentenac*, LeGoff* (2024). Extended-depth of field random illumination microscopy, EDF-RIM, provides super-resolved projective imaging. Light, science and applications DOI: 10.1038/s41377-024-01612-0.
-Rigato, Meng, Charles, Runion, Abouakil, Smith, LeGoff (2024). A mechanical transition from tension to buckling underlies the jigsaw puzzle shape morphogenesis of histoblasts in the Drosophila epidermis. PLos Biol, https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3002662
-Meng, Nuzdhin, Sison, Galland, LeGoff (2023). Adaptive scans allow 3D-targeted laser-dissection to probe the mechanics of cell sheets. EPJ Plus, https://rdcu.be/dj9Ms DOI : 10.1140/epjp/s13360-023-04378-3
-Burcklen, Galland, LeGoff (2022). Optimizing sampling for surface localization in 3D-scanning microscopy. JOSA A doi: 10.1364/JOSAA.460077
-Ackermann, Qu, LeGoff*, Ben Amar (*: corresponding author). (2022) Modeling the mechanics of growing epithelia with a bilayer plate theory. EPJ Plus 137:8. DOI:10.1140/epjp/s13360-021-02205-1
-Abouakil, Meng, Burcklen, Rigneault, Galland*, LeGoff* (2021). An adaptive microscope for the imaging of biological surfaces. Light: science and applications 10, 210 (2021). DOI: 10.1038/s41377-021-00649-9
-Ben Amar, Nassoy LeGoff (2019) Physics of growing biological tissues: The complex cross talk between cell activity, growth and resistance. Philosophical Transactions of the Royal Society A. DOI: 10.1098/rsta.2018.0070

Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.


Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.