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PhD thesis : Deep Learning for computer-aided diagnosis of neurological diseases from neuroimaging data (H/F)

This offer is available in the following languages:
Français - Anglais

Date Limite Candidature : lundi 2 août 2021

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General information

Reference : UMR7225-ALEBRI-014
Workplace : PARIS 13
Date of publication : Monday, June 21, 2021
Scientific Responsible name : Olivier COLLIOT
Type of Contract : PhD Student contract / Thesis offer
Contract Period : 36 months
Start date of the thesis : 1 October 2021
Proportion of work : Full time
Remuneration : 2 135,00 € gross monthly

Description of the thesis topic

Neurological diseases are a major public health problem. Early and accurate diagnosis is essential to provide adequate patient care and design effective clinical trials to find new treatments. Neuroimaging plays a major role in the diagnosis of these disorders. Artificial intelligence techniques offer significant promise to assist diagnosis.
The objective of this project is to design and validate deep learning methods for computer-assisted diagnosis of neurological disorders. Three research axes are proposed.
The first one concerns the segmentation of brain structures and lesions, in particular using self-supervised or weakly supervised learning techniques.
The second concerns the development of methods for automatic classification of patients in order to improve differential diagnosis.
The third, more prospective, aims at designing models that could automatically generate medical reports from imaging data.
The developed approaches will be applied to different patient databases acquired by our partners from the Brain Institute and the Pitié-Salpêtrière Hospital and which concern Parkinson's disease and related syndromes, multiple sclerosis and Alzheimer's disease.

Work Context

Vous travaillerez au sein du laboratoire ARAMIS (www.aramislab.fr) de l'Institut du cerveau de Paris. L'institut est idéalement situé au cœur de l'hôpital de la Pitié-Salpêtrière, au centre de Paris.
Le laboratoire ARAMIS, qui fait également partie de l'Inria (Institut national de recherche en informatique et en mathématiques appliquées), se consacre au développement de nouvelles approches informatiques pour l'analyse de grands ensembles de données cliniques et de neuroimagerie. Avec environ 35 personnes, le laboratoire a une composition multidisciplinaire, réunissant des chercheurs en apprentissage machine et en statistiques et des médecins (neurologues, neuroradiologues).
Nous avons accès à un supercalculateur comprenant 1044 GPU nVIDIA V100.
Pour plus d'informations, merci de contacter Olivier Colliot (https://www.aramislab.fr/perso/colliot/)

Constraints and risks

Pas de contraintes particulières

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