Informations générales
Intitulé de l'offre : Doctorate (M/F) Modeling and investigation of the genomic selectivity of a new generation of G4 ligands in cancer models. (H/F)
Référence : UMR7086-ANTMON-001
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : PARIS 13
Date de publication : lundi 16 juin 2025
Type de contrat : CDD Doctorant
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 1 octobre 2025
Quotité de travail : Complet
Rémunération : 2200 gross monthly
Section(s) CN : 13 - Chimie physique, théorique et analytique
Description du sujet de thèse
Dans une première phase, la sélectivité des 12 ligands G4 sera évaluée par modélisation moléculaire, en analysant leurs interactions avec différentes topologies de G4, complétée par des déterminations d'énergie libre associées à la stabilisation des G4. Cette approche computationnelle vise à identifier les ligands les plus prometteurs sur la base de leur sélectivité structurale, sélectivité qui sera ensuite validée expérimentalement par des mesures de FRET, de dichroïsme circulaire (CD) et de spectroscopie UV.
Dans une seconde phase, réalisée au sein du laboratoire CRAN, les ligands G4 sélectionnés feront l'objet d'une cartographie génomique (par les techniques haut débit CUT&Tag et G4access) dans des modèles cellulaires de cancer, permettant l'identification de leurs cibles génomiques et la vérification de leur sélectivité de liaison. En parallèle, une analyse transcriptomique sera menée afin d'établir des corrélations entre la stabilisation des G4 et la régulation de l'expression génique.
Contexte de travail
The proposed PhD project will be conducted over two consecutive periods of 18 months, the first at Université Paris Cité (ITODYS) and the second at Université de Lorraine in Vandœuvre-lès-Nancy (CRAN). The student will be enrolled at the Université Paris Cité and at the ED388 Chimie Physique et Chilmie Analytique de Paris Centre.
This PhD project is funded by the MITI program (Mission for Transversal and Interdisciplinary Initiatives), which aims to support interdisciplinary and cross-cutting research projects.
All necessary experimental and computational resources will be available within the ITODYS and CRAN research teams, including access to biological testing facilities and national high-performance computing centers. Thanks to the dual focus of the project, the PhD student will develop not only strong expertise in molecular modeling, but also in molecular biology and omics data analysis
Contraintes et risques
No particular risks
Informations complémentaires
The candidate must provide a CV, a cover letter tailored to the position, as well as their Master's (M2) transcripts and class ranking.